44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0004 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0004  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  199  9.999999999999999e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.52078  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0003  hypothetical protein  60.82 
 
 		 97 aa  135  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.179596  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0004  hypothetical protein  54.84 
 
 		 102 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.301106  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2009  hypothetical protein  49.48 
 
 		 97 aa  110  7.000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0004  hypothetical protein  50 
 
 		 97 aa  100  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0004  hypothetical protein  40.21 
 
 		 97 aa  98.6  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0004  hypothetical protein  34.41 
 
 		 96 aa  94  7e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.132864 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3498  protein of unknown function DUF721  30.11 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.68574e-33 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3502  protein of unknown function DUF721  32.56 
 
 		 170 aa  53.9  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.428989 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3436  hypothetical protein  30.11 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00123738  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2875  hypothetical protein  39.68 
 
 		 162 aa  51.6  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0140441  hitchhiker  0.0000188483 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2226  hypothetical protein  28.95 
 
 		 168 aa  50.8  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000216141  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1548  protein of unknown function DUF721  33.77 
 
 		 160 aa  50.4  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0658767  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0005  hypothetical protein  24.18 
 
 		 185 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731239  normal  0.310544 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1102  hypothetical protein  28.57 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000565832  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3768  hypothetical protein  34.92 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00373156  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0005  hypothetical protein  32 
 
 		 300 aa  47.8  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0643796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2691  protein of unknown function DUF721  23.91 
 
 		 95 aa  47.4  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0005  protein of unknown function DUF721  30.59 
 
 		 172 aa  47.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.799003 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3330  hypothetical protein  31.76 
 
 		 149 aa  47.4  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0823  hypothetical protein  23.33 
 
 		 188 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0042  hypothetical protein  28.89 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0008  protein of unknown function DUF721  21.74 
 
 		 180 aa  46.2  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1621  hypothetical protein  26.6 
 
 		 287 aa  45.4  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.238182 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0005  protein of unknown function DUF721  26.67 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000106889 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2764  protein of unknown function DUF721  28.57 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.547848  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2995  hypothetical protein  26.67 
 
 		 266 aa  44.7  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.333747  normal  0.629228 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0005  hypothetical protein  26.67 
 
 		 185 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342856  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0095  Zn-ribbon-containing protein  30.77 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142092  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0638  hypothetical protein  29.21 
 
 		 159 aa  43.9  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.128267  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0095  hypothetical protein  30.77 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.437017  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0004  protein of unknown function DUF721  28.99 
 
 		 171 aa  42.4  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00476655  normal  0.0907524 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0004  protein of unknown function DUF721  27.72 
 
 		 105 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0005  protein of unknown function DUF721  22.34 
 
 		 179 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0055  protein of unknown function DUF721  22.11 
 
 		 271 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2709  protein of unknown function DUF721  24.69 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0005  protein of unknown function DUF721  25.53 
 
 		 173 aa  40.8  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10004  hypothetical protein  23.33 
 
 		 187 aa  40.8  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0005  protein of unknown function DUF721  20.88 
 
 		 207 aa  40.8  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0005  hypothetical protein  19.78 
 
 		 190 aa  40.4  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0005  hypothetical protein  19.78 
 
 		 190 aa  40.4  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.935209  normal  0.0649143 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0013  hypothetical protein  19.78 
 
 		 190 aa  40.4  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  23.91 
 
 		 196 aa  40.4  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3716  hypothetical protein  28.57 
 
 		 105 aa  40.4  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.290608 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>