57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2875 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2875  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  323  5e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0140441  hitchhiker  0.0000188483 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0638  hypothetical protein  59.24 
 
 		 159 aa  191  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.128267  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3498  protein of unknown function DUF721  53.15 
 
 		 153 aa  160  6e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.68574e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3436  hypothetical protein  52.45 
 
 		 151 aa  155  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00123738  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3768  hypothetical protein  51.68 
 
 		 152 aa  143  8.000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00373156  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1102  hypothetical protein  44.14 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000565832  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2445  hypothetical protein  44.09 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000048803  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2226  hypothetical protein  32.64 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000216141  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0005  hypothetical protein  31.93 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0643796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2350  hypothetical protein  32.29 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000367866  normal  0.0123481 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3330  hypothetical protein  32.8 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1621  hypothetical protein  33.33 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.238182 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2009  hypothetical protein  35.16 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1602  protein of unknown function DUF721  31.41 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0552613 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2306  protein of unknown function DUF721  26.58 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1548  protein of unknown function DUF721  29.36 
 
 		 160 aa  53.9  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0658767  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0004  protein of unknown function DUF721  31.17 
 
 		 286 aa  53.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000131484  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1258  hypothetical protein  26.43 
 
 		 169 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3502  protein of unknown function DUF721  29.53 
 
 		 170 aa  52  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.428989 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0004  hypothetical protein  39.68 
 
 		 97 aa  51.6  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.52078  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0004  hypothetical protein  28.57 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.132864 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0004  protein of unknown function DUF721  40.3 
 
 		 105 aa  50.4  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0005  hypothetical protein  32 
 
 		 183 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0013  hypothetical protein  33.73 
 
 		 190 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0005  hypothetical protein  33.73 
 
 		 190 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.935209  normal  0.0649143 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0005  hypothetical protein  33.73 
 
 		 190 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2563  protein of unknown function DUF721  34.69 
 
 		 178 aa  47.8  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0004  hypothetical protein  31.33 
 
 		 97 aa  47.8  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3136  hypothetical protein  30.53 
 
 		 175 aa  47.8  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0004  hypothetical protein  28.57 
 
 		 97 aa  47.8  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0164  hypothetical protein  35.71 
 
 		 185 aa  47.4  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5098  protein of unknown function DUF721  34.62 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0628947  normal  0.0645069 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0747  hypothetical protein  26.47 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.301449  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0008  protein of unknown function DUF721  26.17 
 
 		 180 aa  45.8  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0005  hypothetical protein  26.42 
 
 		 185 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731239  normal  0.310544 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4691  hypothetical protein  29.27 
 
 		 197 aa  45.1  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.165026  normal  0.387608 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0916  hypothetical protein  31.11 
 
 		 185 aa  44.7  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2267  hypothetical protein  29.09 
 
 		 198 aa  44.7  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  34.29 
 
 		 266 aa  44.3  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.221602  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0823  hypothetical protein  27.78 
 
 		 188 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1433  Zn-ribbon-containing RNA-binding protein  35.59 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2673  protein of unknown function DUF721  22.81 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.212988  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4401  hypothetical protein  30.85 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1383  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0004  hypothetical protein  35.48 
 
 		 102 aa  42.4  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.301106  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4505  hypothetical protein  28.57 
 
 		 151 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  normal  0.62283 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0029  protein of unknown function DUF1159  28.05 
 
 		 170 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0188375 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0006  hypothetical protein  25.49 
 
 		 198 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00159718  hitchhiker  0.00351653 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0003  hypothetical protein  38.71 
 
 		 97 aa  42.4  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.179596  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0004  protein of unknown function DUF721  29.41 
 
 		 184 aa  42.4  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1344  hypothetical protein  28.57 
 
 		 209 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.444258  decreased coverage  0.0000672782 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0951  hypothetical protein  30.11 
 
 		 151 aa  42  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4380  hypothetical protein  28.57 
 
 		 209 aa  42  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0506505  normal  0.0887943 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0055  protein of unknown function DUF721  26.92 
 
 		 271 aa  41.2  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2303  protein of unknown function DUF721  28.57 
 
 		 156 aa  41.2  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2644  hypothetical protein  25 
 
 		 175 aa  40.8  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4095  hypothetical protein  28.57 
 
 		 161 aa  40.8  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.332241  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0005  hypothetical protein  24.51 
 
 		 201 aa  40.4  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000127236 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>