64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1102 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1102  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  305  1.0000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000565832  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0638  hypothetical protein  40.91 
 
 		 159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.128267  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3768  hypothetical protein  43.36 
 
 		 152 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00373156  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2445  hypothetical protein  42.47 
 
 		 156 aa  104  6e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000048803  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2875  hypothetical protein  44.14 
 
 		 162 aa  103  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0140441  hitchhiker  0.0000188483 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3498  protein of unknown function DUF721  36.91 
 
 		 153 aa  102  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.68574e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3436  hypothetical protein  37.16 
 
 		 151 aa  102  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00123738  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2226  hypothetical protein  28.26 
 
 		 168 aa  70.9  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000216141  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0005  hypothetical protein  28.68 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0643796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0095  hypothetical protein  40.91 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.437017  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5457  protein of unknown function DUF721  34.09 
 
 		 95 aa  58.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.010243  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0005  protein of unknown function DUF721  32.95 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0095  Zn-ribbon-containing protein  40.91 
 
 		 101 aa  57.4  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142092  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3330  hypothetical protein  39.71 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1171  hypothetical protein  35.92 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1548  protein of unknown function DUF721  35.09 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0658767  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0004  hypothetical protein  31.87 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.301106  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0004  hypothetical protein  29.67 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0004  hypothetical protein  32.97 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.132864 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3502  protein of unknown function DUF721  31.18 
 
 		 170 aa  52.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.428989 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0004  protein of unknown function DUF721  32.26 
 
 		 105 aa  51.2  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0029  protein of unknown function DUF1159  30.26 
 
 		 170 aa  50.4  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0188375 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2320  hypothetical protein  30.67 
 
 		 144 aa  50.4  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0005  hypothetical protein  30.43 
 
 		 201 aa  50.4  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000127236 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0004  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0005  hypothetical protein  29.55 
 
 		 183 aa  48.9  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10803  hypothetical protein  31.46 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.594174  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0004  hypothetical protein  28.57 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.52078  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0006  Zn-ribbon-containing possibly RNA-binding protein and truncated derivatives-like protein  30.61 
 
 		 206 aa  48.5  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0004  protein of unknown function DUF721  32.86 
 
 		 286 aa  48.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000131484  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1602  protein of unknown function DUF721  29.7 
 
 		 168 aa  48.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0552613 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0164  hypothetical protein  32.61 
 
 		 185 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2306  protein of unknown function DUF721  31.76 
 
 		 175 aa  47.8  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0006  hypothetical protein  29.35 
 
 		 198 aa  47.4  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00159718  hitchhiker  0.00351653 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5098  protein of unknown function DUF721  41.18 
 
 		 178 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0628947  normal  0.0645069 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0535  protein of unknown function DUF721  27.96 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.864734  hitchhiker  0.0000000114959 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3136  hypothetical protein  31.4 
 
 		 175 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2009  hypothetical protein  30.77 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2691  protein of unknown function DUF721  28.72 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6940  hypothetical protein  29.11 
 
 		 161 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0042  hypothetical protein  27.27 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3250  hypothetical protein  27.86 
 
 		 190 aa  45.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.745967  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0544  hypothetical protein  35.94 
 
 		 86 aa  44.7  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000177054  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2350  hypothetical protein  27.12 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000367866  normal  0.0123481 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0611  hypothetical protein  27.27 
 
 		 175 aa  44.3  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7653  protein of unknown function DUF721  29.77 
 
 		 162 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134794  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0005  protein of unknown function DUF721  34.38 
 
 		 207 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0005  protein of unknown function DUF721  28.41 
 
 		 188 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0916  hypothetical protein  31.11 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0005  protein of unknown function DUF721  32.95 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00151548  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2709  protein of unknown function DUF721  22.73 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0005  protein of unknown function DUF721  33.33 
 
 		 217 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382214 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1258  hypothetical protein  26.72 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0005  protein of unknown function DUF721  28.41 
 
 		 166 aa  43.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0005  hypothetical protein  24.71 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  0.25905 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0796  hypothetical protein  46.51 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2644  hypothetical protein  27.59 
 
 		 175 aa  42.4  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2673  protein of unknown function DUF721  22.66 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.212988  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1621  hypothetical protein  30.61 
 
 		 287 aa  41.6  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.238182 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3716  hypothetical protein  29.17 
 
 		 105 aa  41.6  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.290608 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0498  hypothetical protein  24.63 
 
 		 175 aa  41.2  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0422598  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0003  hypothetical protein  28.57 
 
 		 97 aa  41.2  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.179596  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_004310  BR0494  hypothetical protein  24.63 
 
 		 175 aa  41.2  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  34.43 
 
 		 217 aa  40.8  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00080644  normal  0.335319 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>