50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0005 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0005  protein of unknown function DUF721  100 
 
 		 173 aa  328  3e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  58.11 
 
 		 196 aa  155  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0005  hypothetical protein  52.69 
 
 		 188 aa  149  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0005  hypothetical protein  49.13 
 
 		 185 aa  144  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342856  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0005  protein of unknown function DUF721  57.89 
 
 		 217 aa  144  6e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382214 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0005  protein of unknown function DUF721  58.67 
 
 		 171 aa  140  8e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0005  protein of unknown function DUF721  47.4 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000106889 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0005  hypothetical protein  55.46 
 
 		 185 aa  139  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731239  normal  0.310544 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0823  hypothetical protein  54.62 
 
 		 188 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  43.79 
 
 		 196 aa  134  6.0000000000000005e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  55.08 
 
 		 187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0005  protein of unknown function DUF721  51.72 
 
 		 166 aa  120  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0008  protein of unknown function DUF721  48.74 
 
 		 180 aa  118  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  47.13 
 
 		 217 aa  118  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00080644  normal  0.335319 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10004  hypothetical protein  47.06 
 
 		 187 aa  117  6e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0005  hypothetical protein  46.22 
 
 		 190 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.935209  normal  0.0649143 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0013  hypothetical protein  46.22 
 
 		 190 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0005  hypothetical protein  46.22 
 
 		 190 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0005  protein of unknown function DUF721  48.09 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0005  protein of unknown function DUF721  49.58 
 
 		 143 aa  112  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00151548  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0004  hypothetical protein  44.83 
 
 		 164 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0005  hypothetical protein  47.76 
 
 		 273 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0987513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0005  protein of unknown function DUF721  47.46 
 
 		 188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  41.67 
 
 		 266 aa  109  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.221602  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0005  hypothetical protein  46.1 
 
 		 183 aa  106  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0006  Zn-ribbon-containing possibly RNA-binding protein and truncated derivatives-like protein  47.5 
 
 		 206 aa  104  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0005  hypothetical protein  47.29 
 
 		 177 aa  103  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0004  protein of unknown function DUF721  46.22 
 
 		 184 aa  102  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0004  protein of unknown function DUF721  47.86 
 
 		 171 aa  99.4  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00476655  normal  0.0907524 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0005  protein of unknown function DUF721  44.55 
 
 		 172 aa  99.8  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.799003 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0005  protein of unknown function DUF721  41.26 
 
 		 179 aa  95.5  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0006  hypothetical protein  48.55 
 
 		 198 aa  95.1  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00159718  hitchhiker  0.00351653 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0005  hypothetical protein  48.74 
 
 		 201 aa  93.2  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000127236 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0005  hypothetical protein  38.53 
 
 		 134 aa  89  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  0.25905 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0005  hypothetical protein  40.2 
 
 		 173 aa  84.7  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0499719  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0042  hypothetical protein  37.89 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0005  protein of unknown function DUF721  37.5 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00444406 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1433  Zn-ribbon-containing RNA-binding protein  35.24 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0005  hypothetical protein  26.6 
 
 		 300 aa  58.2  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0643796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2226  hypothetical protein  31.03 
 
 		 168 aa  47.8  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000216141  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0004  hypothetical protein  27.27 
 
 		 102 aa  46.6  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.301106  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2009  hypothetical protein  36.07 
 
 		 97 aa  45.8  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3498  protein of unknown function DUF721  30.85 
 
 		 153 aa  45.1  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.68574e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3436  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  45.1  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00123738  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6940  hypothetical protein  29.81 
 
 		 161 aa  43.9  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0638  hypothetical protein  32.22 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.128267  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3768  hypothetical protein  31.11 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00373156  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1548  protein of unknown function DUF721  25.26 
 
 		 160 aa  42  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0658767  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7653  protein of unknown function DUF721  27.88 
 
 		 162 aa  41.6  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134794  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0004  hypothetical protein  25.88 
 
 		 97 aa  40.8  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>