57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2226 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2226  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  342  2e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000216141  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3768  hypothetical protein  38.03 
 
 		 152 aa  99.4  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00373156  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0638  hypothetical protein  34.51 
 
 		 159 aa  88.6  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.128267  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0005  hypothetical protein  26.58 
 
 		 300 aa  80.5  0.000000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0643796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2875  hypothetical protein  32.64 
 
 		 162 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0140441  hitchhiker  0.0000188483 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3436  hypothetical protein  29.08 
 
 		 151 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00123738  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3498  protein of unknown function DUF721  27.66 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.68574e-33 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1102  hypothetical protein  28.26 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000565832  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0008  protein of unknown function DUF721  36.89 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2445  hypothetical protein  34.01 
 
 		 156 aa  63.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000048803  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1548  protein of unknown function DUF721  31.01 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0658767  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3330  hypothetical protein  31.03 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0005  protein of unknown function DUF721  33.78 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.799003 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  30.23 
 
 		 266 aa  54.7  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.221602  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0005  hypothetical protein  31.46 
 
 		 273 aa  54.3  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0987513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2350  hypothetical protein  32.32 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000367866  normal  0.0123481 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0005  hypothetical protein  36.49 
 
 		 185 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731239  normal  0.310544 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0004  hypothetical protein  31.58 
 
 		 96 aa  53.1  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.132864 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0005  protein of unknown function DUF721  26.92 
 
 		 188 aa  52.4  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0823  hypothetical protein  34.67 
 
 		 188 aa  51.6  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0005  hypothetical protein  32.89 
 
 		 190 aa  50.8  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.935209  normal  0.0649143 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0013  hypothetical protein  32.89 
 
 		 190 aa  50.8  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0005  hypothetical protein  32.89 
 
 		 190 aa  50.8  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0004  hypothetical protein  28.95 
 
 		 97 aa  50.8  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.52078  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0005  hypothetical protein  32.5 
 
 		 177 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0004  protein of unknown function DUF721  38.16 
 
 		 105 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10004  hypothetical protein  32.89 
 
 		 187 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0004  hypothetical protein  27.55 
 
 		 97 aa  48.5  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  28.05 
 
 		 187 aa  47.8  0.00008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0005  protein of unknown function DUF721  31.03 
 
 		 173 aa  47.8  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2563  protein of unknown function DUF721  33.78 
 
 		 178 aa  47.8  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0006  hypothetical protein  29.35 
 
 		 198 aa  47.8  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00159718  hitchhiker  0.00351653 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0005  hypothetical protein  29.49 
 
 		 173 aa  47.8  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0499719  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3502  protein of unknown function DUF721  26.25 
 
 		 170 aa  47  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.428989 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0164  hypothetical protein  35.38 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0004  hypothetical protein  31.58 
 
 		 102 aa  46.2  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.301106  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0005  protein of unknown function DUF721  29.49 
 
 		 179 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0005  hypothetical protein  29.49 
 
 		 183 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0095  Zn-ribbon-containing protein  33.33 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142092  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0587  hypothetical protein  34.92 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.683361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0005  hypothetical protein  28.26 
 
 		 201 aa  45.8  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000127236 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0004  protein of unknown function DUF721  31.87 
 
 		 184 aa  45.8  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0612  protein of unknown function DUF721  25.84 
 
 		 96 aa  45.4  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1777  hypothetical protein  31.65 
 
 		 188 aa  45.1  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06201  hypothetical protein  32.91 
 
 		 180 aa  45.1  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0388112 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0095  hypothetical protein  31.82 
 
 		 101 aa  44.7  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.437017  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0005  protein of unknown function DUF721  23.86 
 
 		 217 aa  44.7  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382214 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0005  hypothetical protein  27.47 
 
 		 188 aa  44.7  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2009  hypothetical protein  27.63 
 
 		 97 aa  44.3  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1602  protein of unknown function DUF721  27.95 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0552613 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0005  protein of unknown function DUF721  38.33 
 
 		 166 aa  43.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0005  hypothetical protein  27.84 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  0.25905 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0005  protein of unknown function DUF721  32.14 
 
 		 207 aa  41.2  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0916  hypothetical protein  26.03 
 
 		 185 aa  40.8  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2691  protein of unknown function DUF721  26.88 
 
 		 95 aa  40.4  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1595  protein of unknown function DUF721  25.56 
 
 		 194 aa  40.8  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.215209 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1572  protein of unknown function DUF721  25.56 
 
 		 194 aa  40.8  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>