30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2350 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2350  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  313  4e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000367866  normal  0.0123481 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2563  protein of unknown function DUF721  61.44 
 
 
178 aa  174  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3136  hypothetical protein  53.1 
 
 
175 aa  149  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0041  protein of unknown function DUF721  45 
 
 
176 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.379722  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2306  protein of unknown function DUF721  37.59 
 
 
175 aa  110  6e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2303  protein of unknown function DUF721  36.73 
 
 
156 aa  90.9  6e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2875  hypothetical protein  32.29 
 
 
162 aa  61.6  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0140441  hitchhiker  0.0000188483 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2226  hypothetical protein  32.32 
 
 
168 aa  54.3  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000216141  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0005  hypothetical protein  28.89 
 
 
183 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0232127  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0638  hypothetical protein  26.09 
 
 
159 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.128267  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3436  hypothetical protein  25.86 
 
 
151 aa  48.1  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00123738  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0005  protein of unknown function DUF721  30.34 
 
 
179 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3768  hypothetical protein  31.08 
 
 
152 aa  47.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00373156  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3498  protein of unknown function DUF721  25.86 
 
 
153 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.68574e-33 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06201  hypothetical protein  33.77 
 
 
180 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0388112 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1102  hypothetical protein  27.12 
 
 
155 aa  44.7  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000565832  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3330  hypothetical protein  30.16 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0005  protein of unknown function DUF721  25.84 
 
 
166 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0005  protein of unknown function DUF721  25.66 
 
 
188 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0587  hypothetical protein  30.34 
 
 
173 aa  43.5  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.683361  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  28.79 
 
 
196 aa  42.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0005  hypothetical protein  24.44 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  0.25905 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0042  hypothetical protein  24.72 
 
 
155 aa  41.6  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0008  protein of unknown function DUF721  28.43 
 
 
180 aa  41.6  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1777  hypothetical protein  26.98 
 
 
188 aa  41.2  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5098  protein of unknown function DUF721  28.33 
 
 
178 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0628947  normal  0.0645069 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3502  protein of unknown function DUF721  27.56 
 
 
170 aa  40.8  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.428989 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0004  protein of unknown function DUF721  30.3 
 
 
105 aa  40.8  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04281  hypothetical protein  34.43 
 
 
176 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0005  hypothetical protein  34.33 
 
 
273 aa  40.4  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0987513  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>