53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2445 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2445  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  306  8e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000048803  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1102  hypothetical protein  42.47 
 
 		 155 aa  120  7e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000565832  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0638  hypothetical protein  46.31 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.128267  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2875  hypothetical protein  44.09 
 
 		 162 aa  104  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0140441  hitchhiker  0.0000188483 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3768  hypothetical protein  37.5 
 
 		 152 aa  101  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00373156  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3498  protein of unknown function DUF721  36.91 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.68574e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3436  hypothetical protein  40 
 
 		 151 aa  88.6  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00123738  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2226  hypothetical protein  34.01 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000216141  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3330  hypothetical protein  34.17 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3502  protein of unknown function DUF721  31.2 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.428989 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5457  protein of unknown function DUF721  33.33 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.010243  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0005  hypothetical protein  28.93 
 
 		 300 aa  51.6  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0643796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0004  hypothetical protein  37.5 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.132864 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0004  hypothetical protein  42.19 
 
 		 102 aa  50.8  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.301106  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0005  protein of unknown function DUF721  36.17 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1621  hypothetical protein  32.69 
 
 		 287 aa  49.7  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.238182 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1548  protein of unknown function DUF721  27.86 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0658767  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10004  hypothetical protein  31.11 
 
 		 187 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0042  hypothetical protein  30.21 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0004  hypothetical protein  38.71 
 
 		 97 aa  48.9  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0004  protein of unknown function DUF721  31.46 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2009  hypothetical protein  30.21 
 
 		 97 aa  48.5  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0006  hypothetical protein  30.09 
 
 		 198 aa  47.4  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00159718  hitchhiker  0.00351653 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2306  protein of unknown function DUF721  28.8 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0004  hypothetical protein  29.9 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.52078  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0747  hypothetical protein  27.95 
 
 		 171 aa  44.7  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.301449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0005  hypothetical protein  31.52 
 
 		 201 aa  44.3  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000127236 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2673  protein of unknown function DUF721  20.3 
 
 		 151 aa  44.3  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.212988  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5098  protein of unknown function DUF721  36.62 
 
 		 178 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0628947  normal  0.0645069 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0004  protein of unknown function DUF721  31.82 
 
 		 184 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0095  hypothetical protein  28.75 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.437017  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0004  protein of unknown function DUF721  27.03 
 
 		 286 aa  43.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000131484  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0916  hypothetical protein  31.46 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0005  hypothetical protein  32.5 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.935209  normal  0.0649143 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0005  hypothetical protein  32.5 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0013  hypothetical protein  32.5 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0164  hypothetical protein  33.78 
 
 		 185 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2709  protein of unknown function DUF721  26 
 
 		 106 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  40.98 
 
 		 217 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00080644  normal  0.335319 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1258  hypothetical protein  30 
 
 		 169 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1572  protein of unknown function DUF721  25.27 
 
 		 194 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0587  hypothetical protein  43.75 
 
 		 173 aa  41.6  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.683361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1595  protein of unknown function DUF721  25.27 
 
 		 194 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.215209 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3136  hypothetical protein  31.94 
 
 		 175 aa  42  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0095  Zn-ribbon-containing protein  28.75 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142092  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0005  hypothetical protein  36.51 
 
 		 173 aa  41.2  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0499719  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1433  Zn-ribbon-containing RNA-binding protein  26.88 
 
 		 156 aa  41.2  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0766  hypothetical protein  28.22 
 
 		 172 aa  40.8  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0005  protein of unknown function DUF721  28.26 
 
 		 188 aa  41.2  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1171  hypothetical protein  27.5 
 
 		 186 aa  40.8  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0612  protein of unknown function DUF721  29.51 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0823  hypothetical protein  28.41 
 
 		 188 aa  40.8  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0029  protein of unknown function DUF1159  28.21 
 
 		 170 aa  40.4  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0188375 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>