41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0029 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0029  protein of unknown function DUF1159  100 
 
 		 170 aa  345  1e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0188375 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2644  hypothetical protein  62.82 
 
 		 175 aa  191  4e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0116  hypothetical protein  57.32 
 
 		 176 aa  170  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.165186 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1465  hypothetical protein  57.32 
 
 		 176 aa  170  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.27266  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2096  hypothetical protein  51.52 
 
 		 180 aa  157  7e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.287519 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0063  hypothetical protein  55.62 
 
 		 176 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.448388  normal  0.368675 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0396  hypothetical protein  46.88 
 
 		 179 aa  142  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.939834 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1171  hypothetical protein  33.13 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2320  hypothetical protein  33.09 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4979  protein of unknown function DUF1159  34.21 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160251  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0747  hypothetical protein  31.82 
 
 		 171 aa  68.6  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.301449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1602  protein of unknown function DUF721  32.48 
 
 		 168 aa  67.8  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0552613 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1069  hypothetical protein  31.13 
 
 		 175 aa  64.3  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0959  hypothetical protein  30.63 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209446  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2606  hypothetical protein  31.69 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.23645  normal  0.203976 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6940  hypothetical protein  29.38 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1198  hypothetical protein  33.55 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0544  hypothetical protein  29.61 
 
 		 168 aa  60.5  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21317  normal  0.547637 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7653  protein of unknown function DUF721  29.7 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134794  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2267  hypothetical protein  29.38 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0717  hypothetical protein  29.56 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.924689  normal  0.695432 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3228  hypothetical protein  30.22 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4371  hypothetical protein  28.28 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0866118  normal  0.0388954 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0766  hypothetical protein  28.77 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0611  hypothetical protein  27.22 
 
 		 175 aa  57.4  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3373  protein of unknown function DUF1159  30.43 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.190252  normal  0.945495 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0498  hypothetical protein  31.69 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0422598  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0494  hypothetical protein  31.69 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4691  hypothetical protein  28.32 
 
 		 197 aa  54.3  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.165026  normal  0.387608 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3178  hypothetical protein  29.56 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0708  protein of unknown function DUF721  27.11 
 
 		 163 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0555982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3502  protein of unknown function DUF721  29.63 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0653  protein of unknown function DUF1159  29.29 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.304635 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3250  hypothetical protein  31.94 
 
 		 190 aa  51.2  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.745967  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0416  hypothetical protein  27.01 
 
 		 164 aa  50.8  0.000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1102  hypothetical protein  30.26 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000565832  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1091  hypothetical protein  24.68 
 
 		 182 aa  49.7  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4370  hypothetical protein  29.17 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.968504 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2875  hypothetical protein  28.05 
 
 		 162 aa  42  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0140441  hitchhiker  0.0000188483 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0006  hypothetical protein  27.72 
 
 		 198 aa  41.6  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00159718  hitchhiker  0.00351653 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0006  Zn-ribbon-containing possibly RNA-binding protein and truncated derivatives-like protein  26.37 
 
 		 206 aa  40.8  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>