22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0612 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0612  protein of unknown function DUF721  100 
 
 
96 aa  193  7e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10803  hypothetical protein  50 
 
 
98 aa  94.7  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.594174  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4977  hypothetical protein  43.96 
 
 
98 aa  85.1  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5457  protein of unknown function DUF721  31.18 
 
 
95 aa  61.6  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.010243  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2709  protein of unknown function DUF721  34.09 
 
 
106 aa  60.1  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0535  protein of unknown function DUF721  36.96 
 
 
96 aa  60.1  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.864734  hitchhiker  0.0000000114959 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0004  hypothetical protein  33.33 
 
 
97 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0004  hypothetical protein  26.44 
 
 
96 aa  55.5  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.132864 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2009  hypothetical protein  38.1 
 
 
97 aa  53.9  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3716  hypothetical protein  37.1 
 
 
105 aa  53.5  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.290608 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0216  protein of unknown function DUF721  29.21 
 
 
108 aa  53.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690778  normal  0.772545 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2691  protein of unknown function DUF721  28.74 
 
 
95 aa  50.8  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2995  hypothetical protein  25.81 
 
 
266 aa  48.9  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.333747  normal  0.629228 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0638  hypothetical protein  24.44 
 
 
159 aa  47  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.128267  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0916  hypothetical protein  32.76 
 
 
185 aa  45.4  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1621  hypothetical protein  27.17 
 
 
287 aa  46.2  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.238182 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0003  hypothetical protein  29.76 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.179596  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0672  hypothetical protein  29.89 
 
 
100 aa  45.4  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2226  hypothetical protein  25.84 
 
 
168 aa  45.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000216141  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3330  hypothetical protein  31.75 
 
 
149 aa  44.3  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0095  Zn-ribbon-containing protein  26.44 
 
 
101 aa  41.6  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142092  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1548  protein of unknown function DUF721  29.69 
 
 
160 aa  40.8  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0658767  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>