47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0004 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0004  hypothetical protein  100 
 
 
97 aa  200  4e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0004  hypothetical protein  46.32 
 
 
96 aa  101  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.132864 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0004  hypothetical protein  40.21 
 
 
97 aa  98.6  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.52078  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2009  hypothetical protein  40.21 
 
 
97 aa  94.7  4e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0003  hypothetical protein  42.27 
 
 
97 aa  90.5  8e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.179596  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0004  hypothetical protein  41.67 
 
 
102 aa  89  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.301106  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0004  hypothetical protein  38.14 
 
 
97 aa  82  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3768  hypothetical protein  36.26 
 
 
152 aa  60.5  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00373156  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0612  protein of unknown function DUF721  33.33 
 
 
96 aa  56.2  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2764  protein of unknown function DUF721  30.61 
 
 
100 aa  56.2  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.547848  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1102  hypothetical protein  29.67 
 
 
155 aa  54.3  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000565832  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0638  hypothetical protein  31.87 
 
 
159 aa  53.5  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.128267  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0095  Zn-ribbon-containing protein  45.16 
 
 
101 aa  53.5  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142092  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3498  protein of unknown function DUF721  29.03 
 
 
153 aa  52  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.68574e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3436  hypothetical protein  29.03 
 
 
151 aa  51.6  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00123738  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0005  hypothetical protein  38.24 
 
 
300 aa  50.8  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0643796  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0095  hypothetical protein  38.71 
 
 
101 aa  49.7  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.437017  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1548  protein of unknown function DUF721  36.23 
 
 
160 aa  48.9  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0658767  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2691  protein of unknown function DUF721  26.37 
 
 
95 aa  49.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3502  protein of unknown function DUF721  34.62 
 
 
170 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.428989 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2709  protein of unknown function DUF721  27.84 
 
 
106 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2226  hypothetical protein  27.55 
 
 
168 aa  48.5  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000216141  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0544  hypothetical protein  32.81 
 
 
86 aa  48.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000177054  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10803  hypothetical protein  37.31 
 
 
98 aa  47.8  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.594174  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2995  hypothetical protein  28.09 
 
 
266 aa  47.8  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.333747  normal  0.629228 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2875  hypothetical protein  28.57 
 
 
162 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0140441  hitchhiker  0.0000188483 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3330  hypothetical protein  38.1 
 
 
149 aa  47.4  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0008  protein of unknown function DUF721  21.51 
 
 
180 aa  47.4  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0055  protein of unknown function DUF721  24.72 
 
 
271 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1621  hypothetical protein  25.56 
 
 
287 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.238182 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0004  protein of unknown function DUF721  37.29 
 
 
171 aa  45.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00476655  normal  0.0907524 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0042  hypothetical protein  29.21 
 
 
155 aa  45.1  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0005  hypothetical protein  25.27 
 
 
185 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731239  normal  0.310544 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0005  hypothetical protein  22.47 
 
 
201 aa  43.9  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000127236 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0916  hypothetical protein  33.33 
 
 
185 aa  43.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0005  hypothetical protein  32.26 
 
 
188 aa  42.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5098  protein of unknown function DUF721  41.54 
 
 
178 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0628947  normal  0.0645069 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  29.03 
 
 
196 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0006  Zn-ribbon-containing possibly RNA-binding protein and truncated derivatives-like protein  28.74 
 
 
206 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0006  hypothetical protein  22.73 
 
 
198 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00159718  hitchhiker  0.00351653 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0823  hypothetical protein  23.33 
 
 
188 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0005  hypothetical protein  23.08 
 
 
190 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.935209  normal  0.0649143 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0013  hypothetical protein  23.08 
 
 
190 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0005  hypothetical protein  23.08 
 
 
190 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5457  protein of unknown function DUF721  25.27 
 
 
95 aa  40.8  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.010243  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0535  protein of unknown function DUF721  26.6 
 
 
96 aa  40.4  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.864734  hitchhiker  0.0000000114959 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0005  hypothetical protein  30.51 
 
 
173 aa  40.4  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0499719  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>