33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0004 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0004  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  210  3.9999999999999995e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.301106  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0004  hypothetical protein  54.84 
 
 		 97 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.52078  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2009  hypothetical protein  45.83 
 
 		 97 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0003  hypothetical protein  47.31 
 
 		 97 aa  99.4  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.179596  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0004  hypothetical protein  48.39 
 
 		 97 aa  92.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0004  hypothetical protein  41.67 
 
 		 97 aa  89  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0004  hypothetical protein  39.36 
 
 		 96 aa  89.4  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.132864 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3502  protein of unknown function DUF721  31.68 
 
 		 170 aa  57  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.428989 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1102  hypothetical protein  31.87 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000565832  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1548  protein of unknown function DUF721  34.15 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0658767  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0005  hypothetical protein  37.33 
 
 		 300 aa  50.8  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0643796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3716  hypothetical protein  28.42 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.290608 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0095  hypothetical protein  35.38 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.437017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0095  Zn-ribbon-containing protein  35.38 
 
 		 101 aa  47.4  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142092  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0005  protein of unknown function DUF721  27.27 
 
 		 173 aa  47.4  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0638  hypothetical protein  35.48 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.128267  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2691  protein of unknown function DUF721  24.18 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2226  hypothetical protein  31.58 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000216141  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0042  hypothetical protein  25.26 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0005  hypothetical protein  28.89 
 
 		 185 aa  44.3  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342856  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0005  protein of unknown function DUF721  26.97 
 
 		 166 aa  44.3  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0005  protein of unknown function DUF721  28.89 
 
 		 185 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000106889 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5098  protein of unknown function DUF721  38.46 
 
 		 178 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0628947  normal  0.0645069 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2875  hypothetical protein  35.48 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0140441  hitchhiker  0.0000188483 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2445  hypothetical protein  42.19 
 
 		 156 aa  41.2  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000048803  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0005  hypothetical protein  23.33 
 
 		 185 aa  41.2  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731239  normal  0.310544 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3330  hypothetical protein  36.07 
 
 		 149 aa  41.2  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0535  protein of unknown function DUF721  32.79 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.864734  hitchhiker  0.0000000114959 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0004  protein of unknown function DUF721  26.6 
 
 		 171 aa  41.6  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00476655  normal  0.0907524 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5457  protein of unknown function DUF721  31.25 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.010243  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0823  hypothetical protein  23.08 
 
 		 188 aa  40.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3436  hypothetical protein  33.87 
 
 		 151 aa  40.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00123738  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3768  hypothetical protein  26.37 
 
 		 152 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00373156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>