51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0004 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0004  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  199  9.999999999999999e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.132864 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0004  hypothetical protein  46.32 
 
 		 97 aa  101  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0004  hypothetical protein  34.41 
 
 		 97 aa  94  7e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.52078  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2009  hypothetical protein  37.23 
 
 		 97 aa  89.4  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0004  hypothetical protein  39.36 
 
 		 102 aa  89.4  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.301106  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0003  hypothetical protein  40.86 
 
 		 97 aa  87.8  5e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.179596  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0004  hypothetical protein  42.86 
 
 		 97 aa  84  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2691  protein of unknown function DUF721  31.52 
 
 		 95 aa  58.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0612  protein of unknown function DUF721  26.44 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1621  hypothetical protein  28.57 
 
 		 287 aa  55.5  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.238182 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2709  protein of unknown function DUF721  32.86 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3768  hypothetical protein  40.32 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00373156  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1102  hypothetical protein  32.97 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000565832  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2226  hypothetical protein  31.58 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000216141  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1548  protein of unknown function DUF721  31.87 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0658767  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2875  hypothetical protein  28.57 
 
 		 162 aa  51.6  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0140441  hitchhiker  0.0000188483 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0638  hypothetical protein  27.47 
 
 		 159 aa  50.8  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.128267  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0535  protein of unknown function DUF721  31.43 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.864734  hitchhiker  0.0000000114959 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0095  hypothetical protein  38.46 
 
 		 101 aa  50.1  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.437017  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3502  protein of unknown function DUF721  27.96 
 
 		 170 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.428989 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0005  hypothetical protein  29.89 
 
 		 188 aa  47.4  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0008  protein of unknown function DUF721  22.83 
 
 		 180 aa  47.8  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0095  Zn-ribbon-containing protein  36.92 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142092  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0005  hypothetical protein  34.67 
 
 		 300 aa  47.4  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0643796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0004  protein of unknown function DUF721  29.17 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0005  hypothetical protein  23.66 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  0.25905 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0544  hypothetical protein  31.25 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000177054  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2764  protein of unknown function DUF721  26.37 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.547848  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3498  protein of unknown function DUF721  22.58 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.68574e-33 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10803  hypothetical protein  27.27 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.594174  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5098  protein of unknown function DUF721  33.85 
 
 		 178 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0628947  normal  0.0645069 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0916  hypothetical protein  27.91 
 
 		 185 aa  42.7  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3436  hypothetical protein  22.58 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00123738  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3716  hypothetical protein  27.14 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.290608 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0055  protein of unknown function DUF721  26.32 
 
 		 271 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4977  hypothetical protein  23.71 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0004  protein of unknown function DUF721  23.91 
 
 		 171 aa  42.4  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00476655  normal  0.0907524 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3330  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0216  protein of unknown function DUF721  32.79 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690778  normal  0.772545 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2445  hypothetical protein  37.5 
 
 		 156 aa  41.2  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000048803  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0397  hypothetical protein  29.17 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1258  hypothetical protein  32.26 
 
 		 169 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10004  hypothetical protein  24.44 
 
 		 187 aa  41.2  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0013  hypothetical protein  23.33 
 
 		 190 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0004  hypothetical protein  25.27 
 
 		 164 aa  40.8  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0005  hypothetical protein  23.33 
 
 		 190 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.935209  normal  0.0649143 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0005  hypothetical protein  23.33 
 
 		 190 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0005  protein of unknown function DUF721  27.27 
 
 		 143 aa  40.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00151548  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0005  hypothetical protein  23.6 
 
 		 201 aa  40.4  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000127236 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2995  hypothetical protein  24.59 
 
 		 266 aa  40  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.333747  normal  0.629228 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  26.67 
 
 		 266 aa  40  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.221602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>