40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0095 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0095  hypothetical protein  100 
 
 		 101 aa  203  7e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.437017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0095  Zn-ribbon-containing protein  92.08 
 
 		 101 aa  193  6e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142092  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1102  hypothetical protein  40.91 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000565832  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0005  protein of unknown function DUF721  34.33 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0005  hypothetical protein  36.23 
 
 		 300 aa  53.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0643796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0672  hypothetical protein  32.14 
 
 		 100 aa  50.4  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0006  Zn-ribbon-containing possibly RNA-binding protein and truncated derivatives-like protein  32.39 
 
 		 206 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1548  protein of unknown function DUF721  35.85 
 
 		 160 aa  50.1  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0658767  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0004  hypothetical protein  38.46 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.132864 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0004  hypothetical protein  38.71 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0003  hypothetical protein  30.23 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.179596  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0004  hypothetical protein  35.38 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.301106  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0004  hypothetical protein  32.39 
 
 		 164 aa  47.4  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1621  hypothetical protein  34.85 
 
 		 287 aa  47.4  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.238182 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  37.29 
 
 		 196 aa  47.4  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10004  hypothetical protein  23.53 
 
 		 187 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0005  hypothetical protein  36.36 
 
 		 273 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0987513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3436  hypothetical protein  34.85 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00123738  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3498  protein of unknown function DUF721  34.85 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.68574e-33 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0005  hypothetical protein  33.33 
 
 		 177 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2009  hypothetical protein  33.85 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2226  hypothetical protein  31.82 
 
 		 168 aa  44.7  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000216141  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3330  hypothetical protein  31.82 
 
 		 149 aa  44.7  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3768  hypothetical protein  32.81 
 
 		 152 aa  44.3  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00373156  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0004  protein of unknown function DUF721  28.87 
 
 		 105 aa  44.3  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0004  hypothetical protein  30.77 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.52078  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0005  protein of unknown function DUF721  29.63 
 
 		 185 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000106889 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0005  hypothetical protein  32.2 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  0.25905 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5457  protein of unknown function DUF721  28.57 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.010243  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0005  hypothetical protein  28.81 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0967  hypothetical protein  33.33 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0005  hypothetical protein  28.57 
 
 		 188 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0005  hypothetical protein  31.11 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342856  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0042  hypothetical protein  28.57 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0005  hypothetical protein  26.23 
 
 		 201 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000127236 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0005  protein of unknown function DUF721  23.53 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1433  Zn-ribbon-containing RNA-binding protein  34.04 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0005  hypothetical protein  27.14 
 
 		 173 aa  41.2  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0499719  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2709  protein of unknown function DUF721  27.69 
 
 		 106 aa  41.2  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10803  hypothetical protein  33.87 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.594174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>