52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_2009 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_2009  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  195  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0003  hypothetical protein  51.55 
 
 		 97 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.179596  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0004  hypothetical protein  49.48 
 
 		 97 aa  110  7.000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.52078  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0004  hypothetical protein  45.83 
 
 		 102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.301106  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0004  hypothetical protein  40.21 
 
 		 97 aa  94.7  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0004  hypothetical protein  42.27 
 
 		 97 aa  90.5  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0004  hypothetical protein  37.23 
 
 		 96 aa  89.4  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.132864 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3502  protein of unknown function DUF721  32.98 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.428989 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2875  hypothetical protein  35.16 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0140441  hitchhiker  0.0000188483 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2691  protein of unknown function DUF721  30.77 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3498  protein of unknown function DUF721  32.26 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.68574e-33 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0006  Zn-ribbon-containing possibly RNA-binding protein and truncated derivatives-like protein  30.43 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0612  protein of unknown function DUF721  38.1 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3436  hypothetical protein  31.18 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00123738  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0005  hypothetical protein  34.67 
 
 		 300 aa  53.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0643796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0005  protein of unknown function DUF721  31.46 
 
 		 179 aa  51.2  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0638  hypothetical protein  33.7 
 
 		 159 aa  50.8  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.128267  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1548  protein of unknown function DUF721  32.1 
 
 		 160 aa  50.4  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0658767  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0005  hypothetical protein  38.98 
 
 		 188 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3768  hypothetical protein  32.26 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00373156  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10803  hypothetical protein  32 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.594174  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3716  hypothetical protein  28.42 
 
 		 105 aa  47.8  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.290608 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3330  hypothetical protein  32 
 
 		 149 aa  47.4  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0004  protein of unknown function DUF721  25.81 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00476655  normal  0.0907524 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0006  hypothetical protein  21.11 
 
 		 198 aa  46.2  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00159718  hitchhiker  0.00351653 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1102  hypothetical protein  30.77 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000565832  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2709  protein of unknown function DUF721  33.78 
 
 		 106 aa  46.2  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0095  Zn-ribbon-containing protein  32.31 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142092  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0004  protein of unknown function DUF721  29.47 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0005  hypothetical protein  21.11 
 
 		 201 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000127236 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0005  protein of unknown function DUF721  36.07 
 
 		 173 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0055  protein of unknown function DUF721  29.41 
 
 		 271 aa  45.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0005  hypothetical protein  26.67 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  0.25905 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0095  hypothetical protein  33.85 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.437017  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2995  hypothetical protein  30.59 
 
 		 266 aa  45.1  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.333747  normal  0.629228 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0008  protein of unknown function DUF721  22.83 
 
 		 180 aa  44.7  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0916  hypothetical protein  33.82 
 
 		 185 aa  44.3  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2226  hypothetical protein  27.63 
 
 		 168 aa  44.3  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000216141  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0535  protein of unknown function DUF721  27.03 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.864734  hitchhiker  0.0000000114959 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0005  protein of unknown function DUF721  28.95 
 
 		 217 aa  43.5  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382214 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4977  hypothetical protein  22.92 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0005  hypothetical protein  27.96 
 
 		 273 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0987513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5457  protein of unknown function DUF721  33.87 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.010243  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  27.08 
 
 		 196 aa  42.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0005  hypothetical protein  26.97 
 
 		 183 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0005  hypothetical protein  27.66 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0499719  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0164  hypothetical protein  35.71 
 
 		 185 aa  41.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0005  protein of unknown function DUF721  23.33 
 
 		 185 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000106889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0005  protein of unknown function DUF721  31.25 
 
 		 172 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.799003 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0823  hypothetical protein  24.44 
 
 		 188 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0005  hypothetical protein  23.33 
 
 		 185 aa  40.8  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342856  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0005  protein of unknown function DUF721  22.22 
 
 		 207 aa  40.4  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>