54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0005 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0005  protein of unknown function DUF721  100 
 
 		 217 aa  414  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382214 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0005  hypothetical protein  49.75 
 
 		 185 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342856  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0005  hypothetical protein  54.01 
 
 		 188 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0005  protein of unknown function DUF721  49 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000106889 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  57.63 
 
 		 187 aa  144  7.0000000000000006e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0005  protein of unknown function DUF721  60 
 
 		 173 aa  139  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0006  Zn-ribbon-containing possibly RNA-binding protein and truncated derivatives-like protein  58.33 
 
 		 206 aa  135  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  43.63 
 
 		 196 aa  135  7.000000000000001e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0005  hypothetical protein  46.03 
 
 		 185 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731239  normal  0.310544 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0005  hypothetical protein  53.39 
 
 		 177 aa  133  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0823  hypothetical protein  45.08 
 
 		 188 aa  131  6.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0005  hypothetical protein  46.33 
 
 		 190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0005  hypothetical protein  46.33 
 
 		 190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.935209  normal  0.0649143 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0013  hypothetical protein  46.33 
 
 		 190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  52.38 
 
 		 196 aa  125  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0005  protein of unknown function DUF721  60.8 
 
 		 171 aa  125  5e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0005  hypothetical protein  55.12 
 
 		 183 aa  124  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0008  protein of unknown function DUF721  46.97 
 
 		 180 aa  122  6e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0005  hypothetical protein  50.85 
 
 		 273 aa  121  7e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0987513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0005  protein of unknown function DUF721  51.18 
 
 		 166 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0005  protein of unknown function DUF721  46.75 
 
 		 179 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0004  protein of unknown function DUF721  45.03 
 
 		 184 aa  117  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10004  hypothetical protein  48.8 
 
 		 187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  40.46 
 
 		 266 aa  112  5e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.221602  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0005  protein of unknown function DUF721  50 
 
 		 188 aa  112  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0005  hypothetical protein  45.53 
 
 		 134 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  0.25905 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0005  protein of unknown function DUF721  48.46 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0005  hypothetical protein  51.46 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000127236 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0006  hypothetical protein  47.2 
 
 		 198 aa  109  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00159718  hitchhiker  0.00351653 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  47.18 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00080644  normal  0.335319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0005  protein of unknown function DUF721  45.95 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.799003 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0004  hypothetical protein  41.41 
 
 		 164 aa  94.7  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0005  hypothetical protein  47.92 
 
 		 173 aa  94.4  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0499719  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0005  protein of unknown function DUF721  46.4 
 
 		 143 aa  93.6  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00151548  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0004  protein of unknown function DUF721  44.92 
 
 		 171 aa  88.6  7e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00476655  normal  0.0907524 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0005  protein of unknown function DUF721  44.68 
 
 		 117 aa  79.7  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00444406 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0042  hypothetical protein  32.63 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1433  Zn-ribbon-containing RNA-binding protein  34.29 
 
 		 156 aa  63.9  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0005  hypothetical protein  23.96 
 
 		 300 aa  52.8  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0643796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3498  protein of unknown function DUF721  26.6 
 
 		 153 aa  48.9  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.68574e-33 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1548  protein of unknown function DUF721  27.37 
 
 		 160 aa  49.3  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0658767  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3768  hypothetical protein  28.4 
 
 		 152 aa  48.9  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00373156  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3436  hypothetical protein  26.6 
 
 		 151 aa  48.5  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00123738  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2226  hypothetical protein  23.86 
 
 		 168 aa  44.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000216141  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0003  hypothetical protein  26.88 
 
 		 97 aa  43.5  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.179596  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2421  hypothetical protein  45.1 
 
 		 159 aa  43.9  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.464043  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0638  hypothetical protein  30.67 
 
 		 159 aa  43.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.128267  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1171  hypothetical protein  31.78 
 
 		 186 aa  43.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1102  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  43.5  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000565832  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2009  hypothetical protein  28.95 
 
 		 97 aa  43.1  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1258  hypothetical protein  29.11 
 
 		 169 aa  42.4  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0095  Zn-ribbon-containing protein  28.81 
 
 		 101 aa  42  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142092  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1621  hypothetical protein  30.68 
 
 		 287 aa  42  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.238182 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1777  hypothetical protein  27.72 
 
 		 188 aa  41.6  0.009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>