50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_00050 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  100 
 
 		 196 aa  386  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0005  protein of unknown function DUF721  63.58 
 
 		 171 aa  158  6e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0005  protein of unknown function DUF721  63.33 
 
 		 173 aa  152  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0823  hypothetical protein  46.11 
 
 		 188 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0005  hypothetical protein  45.45 
 
 		 185 aa  132  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731239  normal  0.310544 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0005  hypothetical protein  46.25 
 
 		 188 aa  128  6e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0005  protein of unknown function DUF721  52.38 
 
 		 217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382214 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0005  hypothetical protein  41.81 
 
 		 190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.935209  normal  0.0649143 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0013  hypothetical protein  41.81 
 
 		 190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0005  hypothetical protein  41.81 
 
 		 190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  44.44 
 
 		 196 aa  124  6e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0005  protein of unknown function DUF721  46.86 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0005  protein of unknown function DUF721  48.89 
 
 		 166 aa  124  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0005  protein of unknown function DUF721  43.98 
 
 		 185 aa  122  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000106889 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0005  hypothetical protein  43.02 
 
 		 185 aa  122  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342856  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10004  hypothetical protein  40.78 
 
 		 187 aa  122  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0008  protein of unknown function DUF721  46.72 
 
 		 180 aa  120  9e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0005  hypothetical protein  47.54 
 
 		 273 aa  118  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0987513  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  47.24 
 
 		 187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0006  Zn-ribbon-containing possibly RNA-binding protein and truncated derivatives-like protein  46.2 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0005  protein of unknown function DUF721  45.26 
 
 		 179 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0005  hypothetical protein  43.2 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  41.92 
 
 		 266 aa  109  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.221602  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  45.86 
 
 		 217 aa  108  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00080644  normal  0.335319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0005  protein of unknown function DUF721  42.86 
 
 		 172 aa  107  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.799003 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0005  protein of unknown function DUF721  44.88 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0005  hypothetical protein  41.88 
 
 		 201 aa  105  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000127236 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0006  hypothetical protein  50 
 
 		 198 aa  106  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00159718  hitchhiker  0.00351653 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0004  hypothetical protein  36.8 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0005  hypothetical protein  41.67 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0005  protein of unknown function DUF721  47.58 
 
 		 143 aa  101  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00151548  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0005  hypothetical protein  41.03 
 
 		 134 aa  99.8  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  0.25905 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0004  protein of unknown function DUF721  40.48 
 
 		 184 aa  99  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0004  protein of unknown function DUF721  43.03 
 
 		 171 aa  97.8  9e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00476655  normal  0.0907524 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0005  hypothetical protein  40.97 
 
 		 173 aa  92.4  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0499719  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0042  hypothetical protein  39.82 
 
 		 155 aa  91.3  8e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0005  protein of unknown function DUF721  39.36 
 
 		 117 aa  77.4  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00444406 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1433  Zn-ribbon-containing RNA-binding protein  35.64 
 
 		 156 aa  74.3  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0005  hypothetical protein  27.37 
 
 		 300 aa  52  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0643796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1777  hypothetical protein  30.69 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3436  hypothetical protein  29.73 
 
 		 151 aa  47.8  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00123738  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3498  protein of unknown function DUF721  29.73 
 
 		 153 aa  47.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.68574e-33 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3330  hypothetical protein  36.92 
 
 		 149 aa  46.6  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3768  hypothetical protein  26.09 
 
 		 152 aa  46.2  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00373156  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0587  hypothetical protein  29.63 
 
 		 173 aa  45.1  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.683361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06201  hypothetical protein  32.5 
 
 		 180 aa  44.7  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0388112 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2009  hypothetical protein  27.66 
 
 		 97 aa  42.4  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0004  hypothetical protein  29.03 
 
 		 97 aa  42.4  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04281  hypothetical protein  30 
 
 		 176 aa  42  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0095  Zn-ribbon-containing protein  26.09 
 
 		 101 aa  41.2  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>