50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_00040 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  100 
 
 		 187 aa  361  3e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0005  hypothetical protein  54.75 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342856  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0005  protein of unknown function DUF721  52.22 
 
 		 185 aa  164  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000106889 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0005  hypothetical protein  57.98 
 
 		 188 aa  145  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0005  protein of unknown function DUF721  57.63 
 
 		 217 aa  144  8.000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382214 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  44.25 
 
 		 196 aa  132  3e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0005  protein of unknown function DUF721  55.08 
 
 		 173 aa  130  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0005  protein of unknown function DUF721  58.2 
 
 		 171 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0005  protein of unknown function DUF721  51.69 
 
 		 207 aa  122  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0005  protein of unknown function DUF721  49.58 
 
 		 166 aa  121  8e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0823  hypothetical protein  50.42 
 
 		 188 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0005  hypothetical protein  50.85 
 
 		 185 aa  118  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731239  normal  0.310544 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0008  protein of unknown function DUF721  48.51 
 
 		 180 aa  117  9e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10004  hypothetical protein  49.23 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0005  hypothetical protein  51.28 
 
 		 183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0005  hypothetical protein  50.85 
 
 		 177 aa  115  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0013  hypothetical protein  44.07 
 
 		 190 aa  114  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0005  hypothetical protein  44.07 
 
 		 190 aa  114  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.935209  normal  0.0649143 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0005  hypothetical protein  44.07 
 
 		 190 aa  114  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  47.24 
 
 		 196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0006  Zn-ribbon-containing possibly RNA-binding protein and truncated derivatives-like protein  49.57 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0005  hypothetical protein  51.26 
 
 		 273 aa  111  5e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0987513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0004  hypothetical protein  46.15 
 
 		 164 aa  111  7.000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0005  hypothetical protein  47.62 
 
 		 134 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  0.25905 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0004  protein of unknown function DUF721  44.7 
 
 		 184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0005  protein of unknown function DUF721  52.1 
 
 		 143 aa  108  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00151548  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  40.78 
 
 		 266 aa  106  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.221602  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  50.42 
 
 		 217 aa  100  9e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00080644  normal  0.335319 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0005  protein of unknown function DUF721  42.45 
 
 		 188 aa  99.8  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0005  protein of unknown function DUF721  42.99 
 
 		 172 aa  98.2  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.799003 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0005  hypothetical protein  45 
 
 		 201 aa  94.7  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000127236 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0006  hypothetical protein  44 
 
 		 198 aa  93.2  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00159718  hitchhiker  0.00351653 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0004  protein of unknown function DUF721  45.95 
 
 		 171 aa  91.3  8e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00476655  normal  0.0907524 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0005  protein of unknown function DUF721  41.12 
 
 		 179 aa  85.5  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0005  hypothetical protein  42.31 
 
 		 173 aa  77.8  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0499719  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0042  hypothetical protein  30 
 
 		 155 aa  67.4  0.0000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1433  Zn-ribbon-containing RNA-binding protein  32.77 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0005  protein of unknown function DUF721  40.66 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00444406 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0005  hypothetical protein  30.99 
 
 		 300 aa  54.3  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0643796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3498  protein of unknown function DUF721  29.79 
 
 		 153 aa  52.8  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.68574e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3436  hypothetical protein  29.79 
 
 		 151 aa  52.4  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00123738  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0164  hypothetical protein  32.69 
 
 		 185 aa  48.1  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2226  hypothetical protein  28.05 
 
 		 168 aa  47.8  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000216141  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3502  protein of unknown function DUF721  26.67 
 
 		 170 aa  46.6  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.428989 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0959  hypothetical protein  29.53 
 
 		 189 aa  45.8  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209446  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2995  hypothetical protein  29.76 
 
 		 266 aa  44.7  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.333747  normal  0.629228 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1258  hypothetical protein  30 
 
 		 169 aa  43.9  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3768  hypothetical protein  26.36 
 
 		 152 aa  43.5  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00373156  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4691  hypothetical protein  32.03 
 
 		 197 aa  42  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.165026  normal  0.387608 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0095  Zn-ribbon-containing protein  29.41 
 
 		 101 aa  41.2  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>