50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4691 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4691  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  389  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.165026  normal  0.387608 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0959  hypothetical protein  63.4 
 
 		 189 aa  200  9e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209446  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2267  hypothetical protein  57.31 
 
 		 198 aa  185  3e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3228  hypothetical protein  34.64 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6940  hypothetical protein  34.25 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2320  hypothetical protein  35.21 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7653  protein of unknown function DUF721  33.33 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134794  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4979  protein of unknown function DUF1159  36.69 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160251  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0717  hypothetical protein  33.12 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.924689  normal  0.695432 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4371  hypothetical protein  31.41 
 
 		 159 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0866118  normal  0.0388954 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2606  hypothetical protein  31.79 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.23645  normal  0.203976 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1602  protein of unknown function DUF721  36.72 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0552613 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0747  hypothetical protein  28.82 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.301449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0396  hypothetical protein  30.11 
 
 		 179 aa  67.8  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.939834 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0766  hypothetical protein  30.86 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1171  hypothetical protein  31.33 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1069  hypothetical protein  29.75 
 
 		 175 aa  64.7  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0708  protein of unknown function DUF721  28.22 
 
 		 163 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0555982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0116  hypothetical protein  29.93 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.165186 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1465  hypothetical protein  29.93 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.27266  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1198  hypothetical protein  34.31 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3250  hypothetical protein  34.76 
 
 		 190 aa  62  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.745967  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3373  protein of unknown function DUF1159  33.33 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.190252  normal  0.945495 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3502  protein of unknown function DUF721  32.22 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0063  hypothetical protein  32.48 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.448388  normal  0.368675 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3178  hypothetical protein  32.22 
 
 		 158 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0653  protein of unknown function DUF1159  29.45 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.304635 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2033  protein of unknown function DUF1159  36.67 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0187777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0544  hypothetical protein  30.37 
 
 		 168 aa  57.4  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21317  normal  0.547637 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0498  hypothetical protein  32.73 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0422598  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0494  hypothetical protein  32.73 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1091  hypothetical protein  28.4 
 
 		 182 aa  54.3  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0390  hypothetical protein  39.19 
 
 		 113 aa  54.7  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0029  protein of unknown function DUF1159  28.32 
 
 		 170 aa  54.3  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0188375 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4370  hypothetical protein  34.94 
 
 		 178 aa  50.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.968504 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2096  hypothetical protein  30.17 
 
 		 180 aa  50.1  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.287519 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0611  hypothetical protein  29.09 
 
 		 175 aa  48.5  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0706  hypothetical protein  35.71 
 
 		 108 aa  48.1  0.00008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0709  hypothetical protein  35.71 
 
 		 108 aa  48.1  0.00008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0713  hypothetical protein  35.71 
 
 		 108 aa  48.1  0.00008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.107913  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2644  hypothetical protein  29.66 
 
 		 175 aa  47.8  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3498  protein of unknown function DUF721  30.83 
 
 		 153 aa  46.2  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.68574e-33 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2196  hypothetical protein  39.33 
 
 		 180 aa  45.8  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.644073 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3436  hypothetical protein  32.5 
 
 		 151 aa  45.1  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00123738  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0005  hypothetical protein  32.61 
 
 		 188 aa  44.7  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2875  hypothetical protein  29.27 
 
 		 162 aa  45.1  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0140441  hitchhiker  0.0000188483 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0349  hypothetical protein  31.43 
 
 		 108 aa  44.3  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.182505  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0638  hypothetical protein  30.52 
 
 		 159 aa  43.9  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.128267  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0416  hypothetical protein  31.71 
 
 		 164 aa  42.7  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  32.03 
 
 		 187 aa  42  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>