39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0116 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0116  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  353  7.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.165186 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1465  hypothetical protein  99.43 
 
 
176 aa  352  2e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.27266  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0063  hypothetical protein  93.75 
 
 
176 aa  300  9e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.448388  normal  0.368675 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2644  hypothetical protein  57.41 
 
 
175 aa  181  5.0000000000000004e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2096  hypothetical protein  56.14 
 
 
180 aa  171  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.287519 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0029  protein of unknown function DUF1159  57.32 
 
 
170 aa  170  9e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0188375 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0396  hypothetical protein  46.39 
 
 
179 aa  146  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.939834 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2267  hypothetical protein  32.37 
 
 
198 aa  77.8  0.00000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0959  hypothetical protein  32.73 
 
 
189 aa  76.3  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209446  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0717  hypothetical protein  34.46 
 
 
160 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.924689  normal  0.695432 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6940  hypothetical protein  36.23 
 
 
161 aa  71.2  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1171  hypothetical protein  31.33 
 
 
186 aa  70.5  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7653  protein of unknown function DUF721  34.01 
 
 
162 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134794  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0747  hypothetical protein  30.72 
 
 
171 aa  68.6  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.301449  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1069  hypothetical protein  33.11 
 
 
175 aa  68.2  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2320  hypothetical protein  32.17 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4691  hypothetical protein  30.59 
 
 
197 aa  66.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.165026  normal  0.387608 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4979  protein of unknown function DUF1159  36.49 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160251  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0766  hypothetical protein  32.52 
 
 
172 aa  63.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0708  protein of unknown function DUF721  31.25 
 
 
163 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0555982  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0416  hypothetical protein  27.95 
 
 
164 aa  60.5  0.00000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1198  hypothetical protein  30.72 
 
 
165 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0611  hypothetical protein  28.74 
 
 
175 aa  58.9  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1091  hypothetical protein  28.33 
 
 
182 aa  57  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3373  protein of unknown function DUF1159  29.75 
 
 
158 aa  57  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.190252  normal  0.945495 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3502  protein of unknown function DUF721  29.56 
 
 
158 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3178  hypothetical protein  30.06 
 
 
158 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2606  hypothetical protein  29.73 
 
 
209 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.23645  normal  0.203976 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1602  protein of unknown function DUF721  33.57 
 
 
168 aa  56.6  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0552613 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0653  protein of unknown function DUF1159  28.75 
 
 
163 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.304635 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4370  hypothetical protein  32.81 
 
 
178 aa  55.1  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.968504 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0544  hypothetical protein  30.54 
 
 
168 aa  54.7  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21317  normal  0.547637 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3228  hypothetical protein  28.82 
 
 
159 aa  54.3  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0498  hypothetical protein  29.38 
 
 
175 aa  51.2  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0422598  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0494  hypothetical protein  29.38 
 
 
175 aa  51.2  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3250  hypothetical protein  32.37 
 
 
190 aa  50.8  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.745967  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4371  hypothetical protein  27.74 
 
 
159 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0866118  normal  0.0388954 
 
 
-
 
NC_002978  WD0390  hypothetical protein  23.38 
 
 
113 aa  45.8  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0349  hypothetical protein  21.92 
 
 
108 aa  40.8  0.009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.182505  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>