49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6940 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6940  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  317  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7653  protein of unknown function DUF721  90.12 
 
 		 162 aa  283  5.999999999999999e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134794  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3373  protein of unknown function DUF1159  71.88 
 
 		 158 aa  220  8e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.190252  normal  0.945495 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3502  protein of unknown function DUF721  69.38 
 
 		 158 aa  215  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3178  hypothetical protein  68.75 
 
 		 158 aa  214  4e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0717  hypothetical protein  63.75 
 
 		 160 aa  193  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.924689  normal  0.695432 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1069  hypothetical protein  43.42 
 
 		 175 aa  127  6e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2320  hypothetical protein  46.15 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4979  protein of unknown function DUF1159  42.76 
 
 		 159 aa  120  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160251  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3228  hypothetical protein  42.86 
 
 		 159 aa  119  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1602  protein of unknown function DUF721  44.23 
 
 		 168 aa  117  6e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0552613 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1198  hypothetical protein  42.11 
 
 		 165 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2606  hypothetical protein  42.21 
 
 		 209 aa  112  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.23645  normal  0.203976 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1171  hypothetical protein  39.24 
 
 		 186 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0747  hypothetical protein  39.29 
 
 		 171 aa  111  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.301449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0766  hypothetical protein  39.02 
 
 		 172 aa  99  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4371  hypothetical protein  38.16 
 
 		 159 aa  97.1  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0866118  normal  0.0388954 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0708  protein of unknown function DUF721  39.13 
 
 		 163 aa  95.5  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0555982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0653  protein of unknown function DUF1159  37.27 
 
 		 163 aa  91.7  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.304635 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0544  hypothetical protein  37.82 
 
 		 168 aa  90.9  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21317  normal  0.547637 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1091  hypothetical protein  33.14 
 
 		 182 aa  87.4  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3250  hypothetical protein  40.38 
 
 		 190 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.745967  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0494  hypothetical protein  33.54 
 
 		 175 aa  79.3  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0498  hypothetical protein  33.54 
 
 		 175 aa  79.3  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0422598  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4691  hypothetical protein  34.25 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.165026  normal  0.387608 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0611  hypothetical protein  33.33 
 
 		 175 aa  75.9  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0959  hypothetical protein  37.59 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209446  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2267  hypothetical protein  31.51 
 
 		 198 aa  72  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1465  hypothetical protein  36.23 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.27266  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0116  hypothetical protein  36.23 
 
 		 176 aa  70.9  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.165186 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0416  hypothetical protein  25.64 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0396  hypothetical protein  28.97 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.939834 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0029  protein of unknown function DUF1159  29.38 
 
 		 170 aa  60.8  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0188375 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2644  hypothetical protein  32.89 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0063  hypothetical protein  37.08 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.448388  normal  0.368675 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2033  protein of unknown function DUF1159  34.26 
 
 		 153 aa  53.9  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0187777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4370  hypothetical protein  32.31 
 
 		 178 aa  48.9  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.968504 
 
 
-
 
NC_002978  WD0390  hypothetical protein  27.03 
 
 		 113 aa  47.8  0.00007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  31.43 
 
 		 266 aa  47.4  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.221602  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2096  hypothetical protein  32.35 
 
 		 180 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.287519 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1102  hypothetical protein  29.11 
 
 		 155 aa  45.1  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000565832  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0709  hypothetical protein  26.51 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3498  protein of unknown function DUF721  26.11 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.68574e-33 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0706  hypothetical protein  26.51 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0713  hypothetical protein  26.51 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.107913  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0005  protein of unknown function DUF721  29.81 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3436  hypothetical protein  25.48 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00123738  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2196  hypothetical protein  32.32 
 
 		 180 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.644073 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0349  hypothetical protein  23.15 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.182505  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>