58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2033 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2033  protein of unknown function DUF1159  100 
 
 		 153 aa  294  4e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0187777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4691  hypothetical protein  35.54 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.165026  normal  0.387608 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0959  hypothetical protein  34.38 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209446  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0717  hypothetical protein  35.51 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.924689  normal  0.695432 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7653  protein of unknown function DUF721  32.92 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134794  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0653  protein of unknown function DUF1159  31.45 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.304635 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0708  protein of unknown function DUF721  29.17 
 
 		 163 aa  60.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0555982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1091  hypothetical protein  26.62 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4979  protein of unknown function DUF1159  30.07 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160251  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2267  hypothetical protein  31.9 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6940  hypothetical protein  35.1 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0544  hypothetical protein  28.66 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21317  normal  0.547637 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4371  hypothetical protein  34.34 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0866118  normal  0.0388954 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3228  hypothetical protein  28.48 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2606  hypothetical protein  30.46 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.23645  normal  0.203976 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3373  protein of unknown function DUF1159  31.25 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.190252  normal  0.945495 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3502  protein of unknown function DUF721  32.89 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0029  protein of unknown function DUF1159  26.75 
 
 		 170 aa  57.4  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0188375 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3178  hypothetical protein  32.89 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2320  hypothetical protein  30.34 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1602  protein of unknown function DUF721  30.38 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0552613 
 
 
-
 
NC_002978  WD0390  hypothetical protein  31.71 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0766  hypothetical protein  32.14 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1069  hypothetical protein  28.57 
 
 		 175 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0611  hypothetical protein  29.25 
 
 		 175 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1198  hypothetical protein  30.3 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0416  hypothetical protein  25.85 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1171  hypothetical protein  35.38 
 
 		 186 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4370  hypothetical protein  33.65 
 
 		 178 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.968504 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0005  protein of unknown function DUF721  34.25 
 
 		 179 aa  48.9  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3250  hypothetical protein  29.22 
 
 		 190 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.745967  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0498  hypothetical protein  26.21 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0422598  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0494  hypothetical protein  26.21 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0006  hypothetical protein  32.18 
 
 		 198 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00159718  hitchhiker  0.00351653 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0747  hypothetical protein  27.27 
 
 		 171 aa  45.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.301449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0005  protein of unknown function DUF721  30.86 
 
 		 166 aa  44.7  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0005  hypothetical protein  31.03 
 
 		 201 aa  43.9  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000127236 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3330  hypothetical protein  32.94 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10004  hypothetical protein  31.71 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1102  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000565832  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2644  hypothetical protein  28 
 
 		 175 aa  42  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0004  protein of unknown function DUF721  36.76 
 
 		 105 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0706  hypothetical protein  28.4 
 
 		 108 aa  42  0.003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0709  hypothetical protein  28.4 
 
 		 108 aa  42  0.003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0713  hypothetical protein  28.4 
 
 		 108 aa  42  0.003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.107913  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0005  hypothetical protein  22.22 
 
 		 300 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0643796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3502  protein of unknown function DUF721  40.35 
 
 		 170 aa  41.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.428989 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1465  hypothetical protein  27.82 
 
 		 176 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.27266  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0005  hypothetical protein  31.71 
 
 		 190 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0396  hypothetical protein  26.8 
 
 		 179 aa  41.2  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.939834 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0013  hypothetical protein  31.71 
 
 		 190 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0116  hypothetical protein  27.82 
 
 		 176 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.165186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0005  hypothetical protein  31.71 
 
 		 190 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.935209  normal  0.0649143 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  32.35 
 
 		 196 aa  40.8  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  25 
 
 		 196 aa  40.8  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0004  hypothetical protein  28.57 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0006  Zn-ribbon-containing possibly RNA-binding protein and truncated derivatives-like protein  32.88 
 
 		 206 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0005  hypothetical protein  28.4 
 
 		 188 aa  40.4  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>