42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4979 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4979  protein of unknown function DUF1159  100 
 
 		 159 aa  314  3e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160251  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1069  hypothetical protein  81.76 
 
 		 175 aa  257  4e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1198  hypothetical protein  83.02 
 
 		 165 aa  245  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3228  hypothetical protein  72.96 
 
 		 159 aa  238  2e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2606  hypothetical protein  72.96 
 
 		 209 aa  231  3e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.23645  normal  0.203976 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2320  hypothetical protein  72.22 
 
 		 144 aa  209  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4371  hypothetical protein  69.18 
 
 		 159 aa  204  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0866118  normal  0.0388954 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7653  protein of unknown function DUF721  43.79 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134794  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3373  protein of unknown function DUF1159  43.05 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.190252  normal  0.945495 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0747  hypothetical protein  39.52 
 
 		 171 aa  121  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.301449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1171  hypothetical protein  41.06 
 
 		 186 aa  121  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6940  hypothetical protein  42.76 
 
 		 161 aa  120  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1602  protein of unknown function DUF721  43.05 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0552613 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3502  protein of unknown function DUF721  39.74 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3178  hypothetical protein  39.74 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0717  hypothetical protein  39.73 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.924689  normal  0.695432 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0611  hypothetical protein  37.5 
 
 		 175 aa  94  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0766  hypothetical protein  37.33 
 
 		 172 aa  93.6  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0498  hypothetical protein  37.42 
 
 		 175 aa  92.4  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0422598  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0494  hypothetical protein  37.42 
 
 		 175 aa  92.4  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3250  hypothetical protein  43.75 
 
 		 190 aa  85.5  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.745967  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0416  hypothetical protein  33.6 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0396  hypothetical protein  34.64 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.939834 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4691  hypothetical protein  36.69 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.165026  normal  0.387608 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0029  protein of unknown function DUF1159  34.21 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0188375 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0708  protein of unknown function DUF721  29.22 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0555982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0653  protein of unknown function DUF1159  29.22 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.304635 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0544  hypothetical protein  32.03 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21317  normal  0.547637 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2644  hypothetical protein  33.54 
 
 		 175 aa  68.6  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0959  hypothetical protein  32.47 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209446  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0116  hypothetical protein  36.49 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.165186 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1465  hypothetical protein  36.49 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.27266  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1091  hypothetical protein  25.6 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2267  hypothetical protein  30.2 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2096  hypothetical protein  40.48 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.287519 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4370  hypothetical protein  31.25 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.968504 
 
 
-
 
NC_002978  WD0390  hypothetical protein  34.57 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0063  hypothetical protein  34.69 
 
 		 176 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.448388  normal  0.368675 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2033  protein of unknown function DUF1159  29.7 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0187777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0713  hypothetical protein  28.21 
 
 		 108 aa  41.6  0.005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.107913  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0709  hypothetical protein  28.21 
 
 		 108 aa  41.6  0.005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0706  hypothetical protein  28.21 
 
 		 108 aa  41.6  0.005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>