41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2096 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2096  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  363  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.287519 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1465  hypothetical protein  59.63 
 
 		 176 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.27266  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0116  hypothetical protein  59.01 
 
 		 176 aa  180  9.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.165186 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2644  hypothetical protein  50.31 
 
 		 175 aa  169  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0029  protein of unknown function DUF1159  51.52 
 
 		 170 aa  166  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0188375 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0063  hypothetical protein  56.29 
 
 		 176 aa  162  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.448388  normal  0.368675 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0396  hypothetical protein  47.83 
 
 		 179 aa  158  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.939834 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1171  hypothetical protein  33.14 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0611  hypothetical protein  30 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2606  hypothetical protein  33.09 
 
 		 209 aa  62  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.23645  normal  0.203976 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3228  hypothetical protein  41.67 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0708  protein of unknown function DUF721  30.77 
 
 		 163 aa  60.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0555982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2320  hypothetical protein  30.41 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0747  hypothetical protein  28.05 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.301449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1069  hypothetical protein  34.51 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4979  protein of unknown function DUF1159  35.66 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160251  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0494  hypothetical protein  27.49 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0498  hypothetical protein  27.49 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0422598  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1198  hypothetical protein  39.29 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0959  hypothetical protein  29.71 
 
 		 189 aa  54.3  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209446  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4371  hypothetical protein  36.9 
 
 		 159 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0866118  normal  0.0388954 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0653  protein of unknown function DUF1159  30.07 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.304635 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2267  hypothetical protein  32.17 
 
 		 198 aa  52.8  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6940  hypothetical protein  28.83 
 
 		 161 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3250  hypothetical protein  34.03 
 
 		 190 aa  52.8  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.745967  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0544  hypothetical protein  28.37 
 
 		 168 aa  52.4  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21317  normal  0.547637 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1602  protein of unknown function DUF721  27.5 
 
 		 168 aa  52.4  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0552613 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4370  hypothetical protein  36.46 
 
 		 178 aa  51.6  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.968504 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0766  hypothetical protein  28.48 
 
 		 172 aa  51.2  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4691  hypothetical protein  30.36 
 
 		 197 aa  50.8  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.165026  normal  0.387608 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7653  protein of unknown function DUF721  27.33 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134794  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3373  protein of unknown function DUF1159  27.7 
 
 		 158 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.190252  normal  0.945495 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0717  hypothetical protein  33 
 
 		 160 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.924689  normal  0.695432 
 
 
-
 
NC_002978  WD0390  hypothetical protein  31.58 
 
 		 113 aa  44.7  0.0007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3178  hypothetical protein  30.68 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3502  protein of unknown function DUF721  30.68 
 
 		 158 aa  44.3  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1091  hypothetical protein  22.98 
 
 		 182 aa  42.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3502  protein of unknown function DUF721  27.11 
 
 		 170 aa  42  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.428989 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1102  hypothetical protein  29.66 
 
 		 155 aa  42  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000565832  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0416  hypothetical protein  20.37 
 
 		 164 aa  41.6  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0005  hypothetical protein  31.82 
 
 		 183 aa  41.2  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0232127  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>