42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3178 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_3178  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  310  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3502  protein of unknown function DUF721  98.1 
 
 
158 aa  306  6.999999999999999e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3373  protein of unknown function DUF1159  92.41 
 
 
158 aa  291  3e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.190252  normal  0.945495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7653  protein of unknown function DUF721  72.61 
 
 
162 aa  221  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134794  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6940  hypothetical protein  68.75 
 
 
161 aa  214  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0717  hypothetical protein  68.99 
 
 
160 aa  206  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.924689  normal  0.695432 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1069  hypothetical protein  41.72 
 
 
175 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0747  hypothetical protein  41.77 
 
 
171 aa  122  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.301449  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1602  protein of unknown function DUF721  44.81 
 
 
168 aa  121  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0552613 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1198  hypothetical protein  41.06 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4979  protein of unknown function DUF1159  39.74 
 
 
159 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160251  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2320  hypothetical protein  40.85 
 
 
144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3228  hypothetical protein  37.75 
 
 
159 aa  110  8.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2606  hypothetical protein  38.67 
 
 
209 aa  110  9e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.23645  normal  0.203976 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4371  hypothetical protein  39.74 
 
 
159 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0866118  normal  0.0388954 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1171  hypothetical protein  37.09 
 
 
186 aa  102  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0494  hypothetical protein  35.85 
 
 
175 aa  89.7  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0498  hypothetical protein  35.85 
 
 
175 aa  89.7  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0422598  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0766  hypothetical protein  35.29 
 
 
172 aa  89  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0544  hypothetical protein  36.36 
 
 
168 aa  84.7  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21317  normal  0.547637 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0708  protein of unknown function DUF721  34.18 
 
 
163 aa  84  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0555982  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0653  protein of unknown function DUF1159  35.67 
 
 
163 aa  81.3  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.304635 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0611  hypothetical protein  31.85 
 
 
175 aa  79.7  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1091  hypothetical protein  31.76 
 
 
182 aa  78.6  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0416  hypothetical protein  27.92 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2267  hypothetical protein  30.67 
 
 
198 aa  68.6  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3250  hypothetical protein  36.99 
 
 
190 aa  67  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.745967  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4691  hypothetical protein  32.22 
 
 
197 aa  60.8  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.165026  normal  0.387608 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0396  hypothetical protein  29.66 
 
 
179 aa  60.8  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.939834 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0959  hypothetical protein  27.94 
 
 
189 aa  57.4  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209446  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1465  hypothetical protein  28.93 
 
 
176 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.27266  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0116  hypothetical protein  30.06 
 
 
176 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.165186 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0029  protein of unknown function DUF1159  29.56 
 
 
170 aa  53.9  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0188375 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0063  hypothetical protein  34.31 
 
 
176 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.448388  normal  0.368675 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2033  protein of unknown function DUF1159  32.41 
 
 
153 aa  52.4  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0187777  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2644  hypothetical protein  31.33 
 
 
175 aa  51.6  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0390  hypothetical protein  23.86 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4370  hypothetical protein  30.23 
 
 
178 aa  44.3  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.968504 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2096  hypothetical protein  30.68 
 
 
180 aa  44.3  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.287519 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0713  hypothetical protein  25.93 
 
 
108 aa  42.4  0.003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.107913  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0709  hypothetical protein  25.93 
 
 
108 aa  42.4  0.003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0706  hypothetical protein  25.93 
 
 
108 aa  42.4  0.003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>