38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1091 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1091  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0708  protein of unknown function DUF721  58.1 
 
 		 163 aa  208  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0555982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0544  hypothetical protein  59.66 
 
 		 168 aa  206  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21317  normal  0.547637 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0653  protein of unknown function DUF1159  57.54 
 
 		 163 aa  204  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.304635 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0766  hypothetical protein  40.46 
 
 		 172 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0611  hypothetical protein  37.29 
 
 		 175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0494  hypothetical protein  37.85 
 
 		 175 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0498  hypothetical protein  37.85 
 
 		 175 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0422598  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0416  hypothetical protein  36.52 
 
 		 164 aa  121  7e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6940  hypothetical protein  33.14 
 
 		 161 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3373  protein of unknown function DUF1159  32.54 
 
 		 158 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.190252  normal  0.945495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7653  protein of unknown function DUF721  32.35 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134794  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3502  protein of unknown function DUF721  31.76 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3178  hypothetical protein  31.76 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2320  hypothetical protein  31.47 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0747  hypothetical protein  28.24 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.301449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2606  hypothetical protein  29.41 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.23645  normal  0.203976 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0717  hypothetical protein  28.4 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.924689  normal  0.695432 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1198  hypothetical protein  26.79 
 
 		 165 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1602  protein of unknown function DUF721  28.02 
 
 		 168 aa  67  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0552613 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4371  hypothetical protein  27.91 
 
 		 159 aa  67  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0866118  normal  0.0388954 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3228  hypothetical protein  28.24 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1069  hypothetical protein  25.45 
 
 		 175 aa  65.5  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1171  hypothetical protein  25.81 
 
 		 186 aa  60.8  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2267  hypothetical protein  29.37 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2644  hypothetical protein  27.69 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4979  protein of unknown function DUF1159  25.6 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160251  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0116  hypothetical protein  28.33 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.165186 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1465  hypothetical protein  28.33 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.27266  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3250  hypothetical protein  32.05 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.745967  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4691  hypothetical protein  28.4 
 
 		 197 aa  54.3  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.165026  normal  0.387608 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2033  protein of unknown function DUF1159  27.27 
 
 		 153 aa  51.6  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0187777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0959  hypothetical protein  25.84 
 
 		 189 aa  51.6  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209446  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0029  protein of unknown function DUF1159  24.68 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0188375 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0063  hypothetical protein  27.78 
 
 		 176 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.448388  normal  0.368675 
 
 
-
 
NC_002978  WD0390  hypothetical protein  27 
 
 		 113 aa  47  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4370  hypothetical protein  25.85 
 
 		 178 aa  46.2  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.968504 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0396  hypothetical protein  23.24 
 
 		 179 aa  45.8  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.939834 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>