44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3228 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3228  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  318  9.999999999999999e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2606  hypothetical protein  86.79 
 
 		 209 aa  276  1e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.23645  normal  0.203976 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4979  protein of unknown function DUF1159  72.96 
 
 		 159 aa  238  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160251  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1069  hypothetical protein  69.18 
 
 		 175 aa  233  9e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1198  hypothetical protein  69.81 
 
 		 165 aa  229  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4371  hypothetical protein  71.52 
 
 		 159 aa  225  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0866118  normal  0.0388954 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2320  hypothetical protein  68.75 
 
 		 144 aa  213  9e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6940  hypothetical protein  42.86 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1171  hypothetical protein  39.74 
 
 		 186 aa  117  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3373  protein of unknown function DUF1159  44.16 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.190252  normal  0.945495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7653  protein of unknown function DUF721  41.56 
 
 		 162 aa  112  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134794  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3502  protein of unknown function DUF721  38.41 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1602  protein of unknown function DUF721  40.27 
 
 		 168 aa  110  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0552613 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3178  hypothetical protein  37.75 
 
 		 158 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0747  hypothetical protein  37.13 
 
 		 171 aa  107  8.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.301449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0717  hypothetical protein  37.16 
 
 		 160 aa  100  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.924689  normal  0.695432 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0766  hypothetical protein  40.94 
 
 		 172 aa  100  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0494  hypothetical protein  36.42 
 
 		 175 aa  96.7  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0498  hypothetical protein  36.42 
 
 		 175 aa  96.7  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0422598  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0611  hypothetical protein  34.87 
 
 		 175 aa  91.3  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0416  hypothetical protein  35.2 
 
 		 164 aa  86.7  1e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3250  hypothetical protein  37.65 
 
 		 190 aa  84  9e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.745967  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4691  hypothetical protein  34.64 
 
 		 197 aa  80.1  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.165026  normal  0.387608 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2644  hypothetical protein  32.1 
 
 		 175 aa  79  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0708  protein of unknown function DUF721  32.24 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0555982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0653  protein of unknown function DUF1159  31.79 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.304635 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0544  hypothetical protein  30.67 
 
 		 168 aa  73.9  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21317  normal  0.547637 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0959  hypothetical protein  34.44 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209446  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0396  hypothetical protein  30.26 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.939834 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2267  hypothetical protein  29.87 
 
 		 198 aa  67  0.00000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1091  hypothetical protein  28.24 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2096  hypothetical protein  41.67 
 
 		 180 aa  60.8  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.287519 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4370  hypothetical protein  31.68 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.968504 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0029  protein of unknown function DUF1159  30.22 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0188375 
 
 
-
 
NC_002978  WD0390  hypothetical protein  32.56 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2033  protein of unknown function DUF1159  31.68 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0187777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1465  hypothetical protein  28.95 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.27266  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0116  hypothetical protein  29.73 
 
 		 176 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.165186 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0063  hypothetical protein  30.61 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.448388  normal  0.368675 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0706  hypothetical protein  29.49 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0709  hypothetical protein  29.49 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0713  hypothetical protein  29.49 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.107913  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0349  hypothetical protein  30.77 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.182505  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  30.33 
 
 		 187 aa  40.8  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>