21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2196 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2196  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  355  1.9999999999999998e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.644073 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4370  hypothetical protein  32 
 
 
178 aa  77  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.968504 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0747  hypothetical protein  30.41 
 
 
171 aa  52.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.301449  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4691  hypothetical protein  39.33 
 
 
197 aa  51.6  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.165026  normal  0.387608 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7653  protein of unknown function DUF721  33.33 
 
 
162 aa  51.2  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134794  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0959  hypothetical protein  35.64 
 
 
189 aa  50.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209446  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6940  hypothetical protein  32.32 
 
 
161 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0708  protein of unknown function DUF721  28.47 
 
 
163 aa  49.3  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0555982  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1171  hypothetical protein  34.38 
 
 
186 aa  48.9  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0766  hypothetical protein  33.59 
 
 
172 aa  48.5  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2267  hypothetical protein  34.02 
 
 
198 aa  47.8  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2606  hypothetical protein  32.82 
 
 
209 aa  47.4  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.23645  normal  0.203976 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2417  hypothetical protein  26.89 
 
 
128 aa  45.8  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2644  hypothetical protein  31.97 
 
 
175 aa  44.3  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3228  hypothetical protein  29.38 
 
 
159 aa  43.9  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1069  hypothetical protein  28.66 
 
 
175 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4979  protein of unknown function DUF1159  32.74 
 
 
159 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160251  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1602  protein of unknown function DUF721  31.78 
 
 
168 aa  42  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0552613 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0653  protein of unknown function DUF1159  27.78 
 
 
163 aa  41.2  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.304635 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3250  hypothetical protein  29.86 
 
 
190 aa  41.2  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.745967  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2320  hypothetical protein  28.77 
 
 
144 aa  40.8  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>