70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0638 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0638  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  320  4e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.128267  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2875  hypothetical protein  59.24 
 
 		 162 aa  191  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0140441  hitchhiker  0.0000188483 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3768  hypothetical protein  51.37 
 
 		 152 aa  148  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00373156  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3436  hypothetical protein  48.63 
 
 		 151 aa  141  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00123738  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3498  protein of unknown function DUF721  47.26 
 
 		 153 aa  140  8e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.68574e-33 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1102  hypothetical protein  40.91 
 
 		 155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000565832  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2445  hypothetical protein  46.31 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000048803  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2226  hypothetical protein  34.51 
 
 		 168 aa  88.6  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000216141  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0005  hypothetical protein  31.09 
 
 		 300 aa  70.9  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0643796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3330  hypothetical protein  31.93 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1548  protein of unknown function DUF721  33.03 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0658767  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0005  hypothetical protein  29.2 
 
 		 185 aa  57  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731239  normal  0.310544 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1621  hypothetical protein  34.29 
 
 		 287 aa  55.5  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.238182 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3502  protein of unknown function DUF721  34.12 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.428989 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0005  hypothetical protein  32.32 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0766  hypothetical protein  33.96 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0005  protein of unknown function DUF721  32.63 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0005  hypothetical protein  29.41 
 
 		 190 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0005  hypothetical protein  29.41 
 
 		 190 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.935209  normal  0.0649143 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5457  protein of unknown function DUF721  33.72 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.010243  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0013  hypothetical protein  29.41 
 
 		 190 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0004  hypothetical protein  31.87 
 
 		 97 aa  53.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0004  hypothetical protein  32.18 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0008  protein of unknown function DUF721  26.55 
 
 		 180 aa  52.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0005  hypothetical protein  33.33 
 
 		 173 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0499719  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0959  hypothetical protein  33.12 
 
 		 189 aa  51.2  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209446  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10004  hypothetical protein  32.53 
 
 		 187 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2009  hypothetical protein  33.7 
 
 		 97 aa  50.8  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2306  protein of unknown function DUF721  29.59 
 
 		 175 aa  50.8  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0004  hypothetical protein  27.47 
 
 		 96 aa  50.8  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.132864 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5098  protein of unknown function DUF721  40.91 
 
 		 178 aa  50.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0628947  normal  0.0645069 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0006  Zn-ribbon-containing possibly RNA-binding protein and truncated derivatives-like protein  27.78 
 
 		 206 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0004  protein of unknown function DUF721  35.94 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0005  hypothetical protein  34.31 
 
 		 177 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0004  protein of unknown function DUF721  30 
 
 		 184 aa  48.5  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0164  hypothetical protein  36.92 
 
 		 185 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2350  hypothetical protein  26.09 
 
 		 153 aa  48.5  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000367866  normal  0.0123481 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0005  hypothetical protein  27.84 
 
 		 201 aa  48.1  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000127236 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  33.71 
 
 		 266 aa  47  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.221602  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0612  protein of unknown function DUF721  24.44 
 
 		 96 aa  47  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0004  hypothetical protein  35.48 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.301106  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0006  hypothetical protein  27.84 
 
 		 198 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00159718  hitchhiker  0.00351653 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0005  hypothetical protein  29.35 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  0.25905 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2563  protein of unknown function DUF721  31.65 
 
 		 178 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1602  protein of unknown function DUF721  26.35 
 
 		 168 aa  45.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0552613 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2709  protein of unknown function DUF721  31.88 
 
 		 106 aa  45.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0005  hypothetical protein  39.73 
 
 		 273 aa  44.7  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0987513  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0005  protein of unknown function DUF721  32.22 
 
 		 173 aa  44.3  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3136  hypothetical protein  36.84 
 
 		 175 aa  44.3  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0916  hypothetical protein  35.21 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4691  hypothetical protein  30.52 
 
 		 197 aa  43.9  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.165026  normal  0.387608 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0005  protein of unknown function DUF721  30.67 
 
 		 217 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382214 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0611  hypothetical protein  31.15 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0004  hypothetical protein  29.21 
 
 		 97 aa  43.9  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.52078  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0544  hypothetical protein  32.31 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000177054  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0494  hypothetical protein  29.51 
 
 		 175 aa  42.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0498  hypothetical protein  29.51 
 
 		 175 aa  42.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0422598  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  34.15 
 
 		 196 aa  42.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0005  protein of unknown function DUF721  40.38 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.799003 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0041  protein of unknown function DUF721  26.6 
 
 		 176 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.379722  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1258  hypothetical protein  25.76 
 
 		 169 aa  42.4  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0005  hypothetical protein  31.31 
 
 		 185 aa  42.4  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342856  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1433  Zn-ribbon-containing RNA-binding protein  26.6 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2644  hypothetical protein  27.7 
 
 		 175 aa  41.6  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0216  protein of unknown function DUF721  26.53 
 
 		 108 aa  41.2  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690778  normal  0.772545 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0005  protein of unknown function DUF721  30.11 
 
 		 185 aa  40.8  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000106889 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  28.43 
 
 		 187 aa  40.8  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0005  hypothetical protein  35.38 
 
 		 188 aa  40.8  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0005  protein of unknown function DUF721  32.56 
 
 		 143 aa  40.4  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00151548  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0747  hypothetical protein  25.97 
 
 		 171 aa  40.4  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.301449  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>