16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2306 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2306  protein of unknown function DUF721  100 
 
 
175 aa  360  7.0000000000000005e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3136  hypothetical protein  41.86 
 
 
175 aa  124  6e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2303  protein of unknown function DUF721  42.07 
 
 
156 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2350  hypothetical protein  37.59 
 
 
153 aa  110  9e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000367866  normal  0.0123481 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2563  protein of unknown function DUF721  36.24 
 
 
178 aa  96.3  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0041  protein of unknown function DUF721  32.28 
 
 
176 aa  85.1  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.379722  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2875  hypothetical protein  26.58 
 
 
162 aa  54.7  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0140441  hitchhiker  0.0000188483 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0638  hypothetical protein  29.59 
 
 
159 aa  50.8  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.128267  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1102  hypothetical protein  31.76 
 
 
155 aa  47.8  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000565832  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2445  hypothetical protein  28.8 
 
 
156 aa  47  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000048803  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5098  protein of unknown function DUF721  36.46 
 
 
178 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0628947  normal  0.0645069 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1621  hypothetical protein  25.84 
 
 
287 aa  45.4  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.238182 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3498  protein of unknown function DUF721  29.55 
 
 
153 aa  44.3  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.68574e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3436  hypothetical protein  29.46 
 
 
151 aa  44.3  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00123738  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0396  hypothetical protein  30.48 
 
 
179 aa  42  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.939834 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0005  hypothetical protein  30 
 
 
134 aa  41.6  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  0.25905 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>