49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0005 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0005  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  345  2e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0005  hypothetical protein  74.63 
 
 		 273 aa  206  9e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0987513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0005  protein of unknown function DUF721  53.39 
 
 		 217 aa  131  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382214 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0005  hypothetical protein  55.93 
 
 		 185 aa  128  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342856  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0005  protein of unknown function DUF721  55.08 
 
 		 185 aa  125  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000106889 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0008  protein of unknown function DUF721  44.8 
 
 		 180 aa  115  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  50.85 
 
 		 187 aa  114  5e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10004  hypothetical protein  47.15 
 
 		 187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0005  protein of unknown function DUF721  48.87 
 
 		 166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0005  hypothetical protein  46.34 
 
 		 190 aa  111  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0013  hypothetical protein  46.34 
 
 		 190 aa  111  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0005  hypothetical protein  46.34 
 
 		 190 aa  111  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.935209  normal  0.0649143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0006  Zn-ribbon-containing possibly RNA-binding protein and truncated derivatives-like protein  45 
 
 		 206 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  43.2 
 
 		 196 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0006  hypothetical protein  48.18 
 
 		 198 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00159718  hitchhiker  0.00351653 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0005  hypothetical protein  49.06 
 
 		 201 aa  106  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000127236 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0005  hypothetical protein  44.72 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731239  normal  0.310544 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0005  protein of unknown function DUF721  49.15 
 
 		 188 aa  105  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0823  hypothetical protein  46.4 
 
 		 188 aa  105  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0005  protein of unknown function DUF721  50.41 
 
 		 143 aa  104  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00151548  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  40.91 
 
 		 196 aa  103  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0005  hypothetical protein  47.22 
 
 		 134 aa  103  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  0.25905 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0005  hypothetical protein  46.55 
 
 		 183 aa  103  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0005  protein of unknown function DUF721  47.29 
 
 		 173 aa  102  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  45.77 
 
 		 217 aa  100  8e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00080644  normal  0.335319 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0005  hypothetical protein  40.56 
 
 		 188 aa  97.1  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0004  protein of unknown function DUF721  44.92 
 
 		 184 aa  96.3  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0004  hypothetical protein  43.1 
 
 		 164 aa  95.1  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0005  protein of unknown function DUF721  47.37 
 
 		 179 aa  90.9  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  40.91 
 
 		 266 aa  85.9  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.221602  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0005  protein of unknown function DUF721  41.53 
 
 		 171 aa  84.3  8e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0005  protein of unknown function DUF721  44.83 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.799003 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0005  hypothetical protein  40.86 
 
 		 173 aa  77  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0499719  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0005  protein of unknown function DUF721  38.4 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0004  protein of unknown function DUF721  37.1 
 
 		 171 aa  70.1  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00476655  normal  0.0907524 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0005  protein of unknown function DUF721  40.86 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00444406 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1433  Zn-ribbon-containing RNA-binding protein  35.14 
 
 		 156 aa  64.3  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0042  hypothetical protein  29.17 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3768  hypothetical protein  35.16 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00373156  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2226  hypothetical protein  30.95 
 
 		 168 aa  50.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000216141  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0638  hypothetical protein  34.31 
 
 		 159 aa  47.8  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.128267  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3498  protein of unknown function DUF721  29.33 
 
 		 153 aa  46.6  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.68574e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3436  hypothetical protein  29.33 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00123738  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0095  hypothetical protein  33.33 
 
 		 101 aa  45.1  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.437017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0095  Zn-ribbon-containing protein  31.82 
 
 		 101 aa  43.5  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142092  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1548  protein of unknown function DUF721  19.78 
 
 		 160 aa  42  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0658767  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0005  hypothetical protein  22.12 
 
 		 300 aa  41.6  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0643796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0777  hypothetical protein  34.52 
 
 		 146 aa  41.2  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.080705  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2421  hypothetical protein  31.82 
 
 		 159 aa  41.2  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.464043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>