24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2421 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2421  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  311  1.9999999999999998e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.464043  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0777  hypothetical protein  37.08 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.080705  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2853  hypothetical protein  35.82 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0179123  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0005  hypothetical protein  31.37 
 
 
173 aa  48.9  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0499719  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0005  hypothetical protein  42.31 
 
 
134 aa  48.5  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  0.25905 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0005  protein of unknown function DUF721  37.5 
 
 
179 aa  48.5  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3447  hypothetical protein  28.33 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000038127  unclonable  0.0000018391 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0005  protein of unknown function DUF721  42.37 
 
 
217 aa  45.1  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382214 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0004  hypothetical protein  39.44 
 
 
164 aa  44.3  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1959  hypothetical protein  31.65 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0238  hypothetical protein  31.65 
 
 
100 aa  43.9  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0647001  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2828  hypothetical protein  33.33 
 
 
219 aa  43.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.119045  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0006  Zn-ribbon-containing possibly RNA-binding protein and truncated derivatives-like protein  30.68 
 
 
206 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0471  hypothetical protein  36.9 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.396188  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0496  hypothetical protein  36.9 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00166057  normal  0.977883 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3653  hypothetical protein  35.71 
 
 
158 aa  42.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397268  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0005  hypothetical protein  31.82 
 
 
177 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0005  hypothetical protein  33.87 
 
 
201 aa  41.6  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000127236 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4505  hypothetical protein  35.44 
 
 
151 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  normal  0.62283 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3805  hypothetical protein  28.57 
 
 
150 aa  40.8  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310465  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4380  hypothetical protein  35.44 
 
 
209 aa  40.8  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0506505  normal  0.0887943 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1344  hypothetical protein  35.44 
 
 
209 aa  40.8  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.444258  decreased coverage  0.0000672782 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0006  hypothetical protein  33.87 
 
 
198 aa  40.4  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00159718  hitchhiker  0.00351653 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0005  protein of unknown function DUF721  41.38 
 
 
166 aa  40.4  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>