19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0777 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0777  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  282  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.080705  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2853  hypothetical protein  35.66 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0179123  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2028  hypothetical protein  36.62 
 
 
174 aa  64.3  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0951  hypothetical protein  36.36 
 
 
151 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166342  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1344  hypothetical protein  36.84 
 
 
209 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.444258  decreased coverage  0.0000672782 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4380  hypothetical protein  36.84 
 
 
209 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0506505  normal  0.0887943 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4505  hypothetical protein  36.84 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  normal  0.62283 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4401  hypothetical protein  36.36 
 
 
153 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1383  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4095  hypothetical protein  35.45 
 
 
161 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.332241  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2487  hypothetical protein  32.14 
 
 
150 aa  49.7  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000990571  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2421  hypothetical protein  36.11 
 
 
159 aa  48.5  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.464043  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2025  hypothetical protein  28.16 
 
 
171 aa  47  0.00009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000598003  normal  0.759176 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1743  hypothetical protein  29.13 
 
 
171 aa  47  0.00009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658245  normal  0.237572 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0005  hypothetical protein  32.43 
 
 
134 aa  44.7  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  0.25905 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4429  hypothetical protein  36.28 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2193  hypothetical protein  43.75 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00409116  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2183  hypothetical protein  31.13 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000427964  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0005  hypothetical protein  34.52 
 
 
177 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0005  protein of unknown function DUF721  33.33 
 
 
179 aa  40.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>