73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0005 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0005  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  270  4.0000000000000004e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  0.25905 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0006  hypothetical protein  56.14 
 
 
198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00159718  hitchhiker  0.00351653 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0005  hypothetical protein  56.19 
 
 
201 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000127236 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0823  hypothetical protein  50 
 
 
188 aa  122  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10004  hypothetical protein  49.58 
 
 
187 aa  121  4e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0005  hypothetical protein  46.92 
 
 
185 aa  118  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731239  normal  0.310544 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0005  protein of unknown function DUF721  46.88 
 
 
166 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0013  hypothetical protein  49.11 
 
 
190 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0005  hypothetical protein  49.11 
 
 
190 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.935209  normal  0.0649143 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0005  protein of unknown function DUF721  50.85 
 
 
143 aa  116  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00151548  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0005  hypothetical protein  49.11 
 
 
190 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0005  protein of unknown function DUF721  47.9 
 
 
188 aa  114  6e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0005  protein of unknown function DUF721  45.53 
 
 
217 aa  111  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382214 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0004  protein of unknown function DUF721  50.39 
 
 
184 aa  110  5e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  47.62 
 
 
187 aa  110  7.000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0008  protein of unknown function DUF721  44.35 
 
 
180 aa  110  8.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  49.61 
 
 
217 aa  106  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00080644  normal  0.335319 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0005  hypothetical protein  46.36 
 
 
177 aa  104  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0005  hypothetical protein  40.56 
 
 
185 aa  103  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342856  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0005  hypothetical protein  44.88 
 
 
183 aa  103  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0232127  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0005  protein of unknown function DUF721  41.13 
 
 
185 aa  103  8e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000106889 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0005  hypothetical protein  45.54 
 
 
273 aa  103  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0987513  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0005  hypothetical protein  41.09 
 
 
188 aa  101  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  41.03 
 
 
196 aa  99.4  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  42.06 
 
 
196 aa  99.8  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0005  protein of unknown function DUF721  45.79 
 
 
179 aa  97.8  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0005  protein of unknown function DUF721  40.16 
 
 
172 aa  96.7  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.799003 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0005  protein of unknown function DUF721  42.61 
 
 
171 aa  95.5  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0006  Zn-ribbon-containing possibly RNA-binding protein and truncated derivatives-like protein  41.51 
 
 
206 aa  94.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0005  protein of unknown function DUF721  43.09 
 
 
207 aa  93.2  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0004  hypothetical protein  42.99 
 
 
164 aa  92  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0005  protein of unknown function DUF721  38.53 
 
 
173 aa  89  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  40.83 
 
 
266 aa  85.9  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.221602  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0004  protein of unknown function DUF721  44.44 
 
 
171 aa  83.2  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00476655  normal  0.0907524 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0005  hypothetical protein  37.38 
 
 
173 aa  82  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0499719  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0042  hypothetical protein  27.19 
 
 
155 aa  68.9  0.00000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0005  protein of unknown function DUF721  35.11 
 
 
117 aa  68.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00444406 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1433  Zn-ribbon-containing RNA-binding protein  35.14 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1777  hypothetical protein  32.76 
 
 
188 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0587  hypothetical protein  33.33 
 
 
173 aa  53.9  0.0000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.683361  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06201  hypothetical protein  39.24 
 
 
180 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0388112 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3498  protein of unknown function DUF721  27.36 
 
 
153 aa  50.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.68574e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3436  hypothetical protein  26.6 
 
 
151 aa  50.4  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00123738  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2421  hypothetical protein  42.31 
 
 
159 aa  48.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.464043  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04281  hypothetical protein  39.71 
 
 
176 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3768  hypothetical protein  32.5 
 
 
152 aa  48.1  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00373156  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0004  protein of unknown function DUF721  35.79 
 
 
105 aa  47.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3502  protein of unknown function DUF721  26.67 
 
 
170 aa  47.4  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.428989 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2691  protein of unknown function DUF721  31.82 
 
 
95 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0638  hypothetical protein  29.35 
 
 
159 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.128267  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1621  hypothetical protein  32.22 
 
 
287 aa  45.4  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.238182 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3330  hypothetical protein  35.59 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0004  hypothetical protein  23.66 
 
 
96 aa  45.4  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.132864 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2009  hypothetical protein  26.67 
 
 
97 aa  45.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0672  hypothetical protein  31.25 
 
 
100 aa  44.7  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0777  hypothetical protein  32.43 
 
 
146 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.080705  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1258  hypothetical protein  26.8 
 
 
169 aa  44.7  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0095  Zn-ribbon-containing protein  29.23 
 
 
101 aa  44.3  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142092  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1548  protein of unknown function DUF721  30.61 
 
 
160 aa  43.9  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0658767  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0498  hypothetical protein  31.11 
 
 
119 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0095  hypothetical protein  32.2 
 
 
101 aa  43.5  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.437017  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0005  hypothetical protein  26.92 
 
 
300 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0643796  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2303  protein of unknown function DUF721  27.47 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0003  hypothetical protein  25.64 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.179596  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2350  hypothetical protein  24.44 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000367866  normal  0.0123481 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1102  hypothetical protein  24.71 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000565832  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2226  hypothetical protein  27.84 
 
 
168 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000216141  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0535  protein of unknown function DUF721  22.09 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.864734  hitchhiker  0.0000000114959 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2306  protein of unknown function DUF721  30 
 
 
175 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2445  hypothetical protein  29.27 
 
 
149 aa  40.8  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000170869  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04871  hypothetical protein  26.51 
 
 
161 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0908407  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2709  protein of unknown function DUF721  26.51 
 
 
106 aa  40  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1171  hypothetical protein  27.72 
 
 
186 aa  40  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>