46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0005 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0005  protein of unknown function DUF721  100 
 
 		 207 aa  391  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  46.86 
 
 		 196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  51.69 
 
 		 187 aa  123  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0005  hypothetical protein  45.45 
 
 		 188 aa  122  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0005  protein of unknown function DUF721  55.15 
 
 		 171 aa  118  4.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0005  protein of unknown function DUF721  49.57 
 
 		 173 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  45.22 
 
 		 196 aa  112  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0005  protein of unknown function DUF721  48.46 
 
 		 217 aa  111  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382214 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0823  hypothetical protein  40.96 
 
 		 188 aa  111  8.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0005  protein of unknown function DUF721  41.76 
 
 		 185 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000106889 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0005  hypothetical protein  39.58 
 
 		 185 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731239  normal  0.310544 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0005  protein of unknown function DUF721  46.83 
 
 		 166 aa  109  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0005  hypothetical protein  41.07 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342856  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0013  hypothetical protein  39.63 
 
 		 190 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0005  hypothetical protein  39.63 
 
 		 190 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.935209  normal  0.0649143 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0005  hypothetical protein  39.63 
 
 		 190 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  39.52 
 
 		 266 aa  104  9e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.221602  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10004  hypothetical protein  42.74 
 
 		 187 aa  104  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0005  hypothetical protein  47.37 
 
 		 183 aa  102  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0004  hypothetical protein  45.69 
 
 		 164 aa  101  7e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0008  protein of unknown function DUF721  39.6 
 
 		 180 aa  101  7e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0004  protein of unknown function DUF721  45.97 
 
 		 184 aa  100  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0005  protein of unknown function DUF721  49.19 
 
 		 143 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00151548  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0005  protein of unknown function DUF721  42.4 
 
 		 188 aa  95.9  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  42.21 
 
 		 217 aa  93.6  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00080644  normal  0.335319 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0005  hypothetical protein  43.09 
 
 		 134 aa  93.2  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  0.25905 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0004  protein of unknown function DUF721  46.06 
 
 		 171 aa  89  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00476655  normal  0.0907524 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0006  Zn-ribbon-containing possibly RNA-binding protein and truncated derivatives-like protein  43.23 
 
 		 206 aa  88.2  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0005  protein of unknown function DUF721  39.47 
 
 		 179 aa  85.5  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0005  hypothetical protein  40.17 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0987513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0005  protein of unknown function DUF721  38.26 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.799003 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0005  hypothetical protein  45.83 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000127236 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0006  hypothetical protein  45.97 
 
 		 198 aa  77.8  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00159718  hitchhiker  0.00351653 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0005  hypothetical protein  38.4 
 
 		 177 aa  76.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0005  hypothetical protein  37.04 
 
 		 173 aa  73.9  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0499719  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0042  hypothetical protein  32.69 
 
 		 155 aa  71.2  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1433  Zn-ribbon-containing RNA-binding protein  31.3 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0005  protein of unknown function DUF721  34.65 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00444406 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3498  protein of unknown function DUF721  27.66 
 
 		 153 aa  45.4  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.68574e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3436  hypothetical protein  27.66 
 
 		 151 aa  45.4  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00123738  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1102  hypothetical protein  34.38 
 
 		 155 aa  44.3  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000565832  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3330  hypothetical protein  35.29 
 
 		 149 aa  42.4  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0433  protein of unknown function DUF721  31.91 
 
 		 148 aa  41.6  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000320142  unclonable  0.00000000000179401 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0419  hypothetical protein  31.91 
 
 		 148 aa  41.6  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000551607  unclonable  0.00000388194 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0407  hypothetical protein  31.91 
 
 		 148 aa  41.6  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171569  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0408  hypothetical protein  31.91 
 
 		 148 aa  41.6  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>