47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0005 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0005  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  520  1e-146  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0987513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0005  hypothetical protein  74.63 
 
 		 177 aa  206  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0005  hypothetical protein  52.14 
 
 		 185 aa  124  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342856  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0005  protein of unknown function DUF721  52.14 
 
 		 185 aa  122  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000106889 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0005  protein of unknown function DUF721  50.85 
 
 		 217 aa  120  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382214 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0005  hypothetical protein  49.18 
 
 		 190 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0013  hypothetical protein  49.18 
 
 		 190 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0005  hypothetical protein  49.18 
 
 		 190 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.935209  normal  0.0649143 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0008  protein of unknown function DUF721  48.84 
 
 		 180 aa  117  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  47.54 
 
 		 196 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10004  hypothetical protein  48.36 
 
 		 187 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0005  protein of unknown function DUF721  46.97 
 
 		 166 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0006  hypothetical protein  51.52 
 
 		 198 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00159718  hitchhiker  0.00351653 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0005  protein of unknown function DUF721  49.57 
 
 		 188 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  51.26 
 
 		 187 aa  110  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0823  hypothetical protein  46.72 
 
 		 188 aa  110  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0005  hypothetical protein  50.82 
 
 		 201 aa  109  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000127236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0006  Zn-ribbon-containing possibly RNA-binding protein and truncated derivatives-like protein  48.33 
 
 		 206 aa  106  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0005  hypothetical protein  45.08 
 
 		 185 aa  105  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731239  normal  0.310544 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  46.28 
 
 		 196 aa  105  7e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0005  hypothetical protein  50.43 
 
 		 183 aa  105  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0005  protein of unknown function DUF721  50.82 
 
 		 143 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00151548  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0004  hypothetical protein  46.55 
 
 		 164 aa  104  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0005  protein of unknown function DUF721  48.33 
 
 		 173 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0005  hypothetical protein  44.83 
 
 		 134 aa  102  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  0.25905 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  47.41 
 
 		 217 aa  101  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00080644  normal  0.335319 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0004  protein of unknown function DUF721  45.3 
 
 		 184 aa  97.8  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0005  hypothetical protein  41.56 
 
 		 188 aa  93.6  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  46.22 
 
 		 266 aa  93.2  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.221602  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0005  protein of unknown function DUF721  47.17 
 
 		 179 aa  92.4  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0005  protein of unknown function DUF721  46.22 
 
 		 171 aa  86.7  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0005  protein of unknown function DUF721  49.4 
 
 		 172 aa  83.2  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.799003 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0005  protein of unknown function DUF721  40.17 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0005  hypothetical protein  43.62 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0499719  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0004  protein of unknown function DUF721  40.16 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00476655  normal  0.0907524 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0005  protein of unknown function DUF721  41.49 
 
 		 117 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00444406 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1433  Zn-ribbon-containing RNA-binding protein  35.71 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0042  hypothetical protein  34.38 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2226  hypothetical protein  31.46 
 
 		 168 aa  53.5  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000216141  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3768  hypothetical protein  34.92 
 
 		 152 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00373156  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3498  protein of unknown function DUF721  34.92 
 
 		 153 aa  46.2  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.68574e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3436  hypothetical protein  34.92 
 
 		 151 aa  46.2  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00123738  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0095  hypothetical protein  36.36 
 
 		 101 aa  45.4  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.437017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0095  Zn-ribbon-containing protein  34.92 
 
 		 101 aa  44.3  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142092  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0638  hypothetical protein  41.18 
 
 		 159 aa  43.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.128267  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2709  protein of unknown function DUF721  25.96 
 
 		 106 aa  42.7  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1548  protein of unknown function DUF721  29.03 
 
 		 160 aa  42.7  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0658767  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>