52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0823 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0823  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  370  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0005  hypothetical protein  81.91 
 
 
185 aa  298  3e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731239  normal  0.310544 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0005  hypothetical protein  75.82 
 
 
190 aa  263  8e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0005  hypothetical protein  75.82 
 
 
190 aa  263  8e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.935209  normal  0.0649143 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0013  hypothetical protein  75.82 
 
 
190 aa  263  8e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10004  hypothetical protein  65.68 
 
 
187 aa  200  9e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0008  protein of unknown function DUF721  60.82 
 
 
180 aa  177  7e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0004  protein of unknown function DUF721  63.33 
 
 
184 aa  165  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0005  protein of unknown function DUF721  57.78 
 
 
166 aa  151  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  62.5 
 
 
217 aa  146  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00080644  normal  0.335319 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0005  protein of unknown function DUF721  52.41 
 
 
188 aa  136  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0005  protein of unknown function DUF721  54.62 
 
 
173 aa  135  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0005  protein of unknown function DUF721  44.17 
 
 
185 aa  133  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000106889 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0005  protein of unknown function DUF721  56 
 
 
143 aa  132  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00151548  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  49.29 
 
 
196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0005  hypothetical protein  41.34 
 
 
188 aa  128  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0005  protein of unknown function DUF721  51.08 
 
 
171 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0005  protein of unknown function DUF721  52.21 
 
 
217 aa  125  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382214 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0005  hypothetical protein  48.48 
 
 
134 aa  125  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  0.25905 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0005  hypothetical protein  41.62 
 
 
185 aa  120  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342856  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  50.42 
 
 
187 aa  118  3.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0006  hypothetical protein  54.89 
 
 
198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00159718  hitchhiker  0.00351653 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  45.52 
 
 
196 aa  115  5e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0005  hypothetical protein  55.74 
 
 
201 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000127236 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0005  hypothetical protein  46.72 
 
 
273 aa  111  5e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0987513  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0005  protein of unknown function DUF721  45.11 
 
 
207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0005  hypothetical protein  46.4 
 
 
177 aa  106  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0004  hypothetical protein  42.24 
 
 
164 aa  103  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0005  hypothetical protein  40.49 
 
 
183 aa  101  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0232127  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0005  protein of unknown function DUF721  44.62 
 
 
172 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.799003 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  41.14 
 
 
266 aa  97.4  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.221602  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0005  protein of unknown function DUF721  35.15 
 
 
179 aa  95.9  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0006  Zn-ribbon-containing possibly RNA-binding protein and truncated derivatives-like protein  44.17 
 
 
206 aa  95.9  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0004  protein of unknown function DUF721  47.5 
 
 
171 aa  91.7  6e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00476655  normal  0.0907524 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0005  hypothetical protein  34.25 
 
 
173 aa  83.6  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0499719  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0042  hypothetical protein  31.07 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0005  protein of unknown function DUF721  35.11 
 
 
117 aa  67  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00444406 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1433  Zn-ribbon-containing RNA-binding protein  34.91 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3436  hypothetical protein  30.85 
 
 
151 aa  61.2  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00123738  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3498  protein of unknown function DUF721  30.85 
 
 
153 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.68574e-33 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3768  hypothetical protein  31.82 
 
 
152 aa  57.4  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00373156  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2226  hypothetical protein  33.77 
 
 
168 aa  51.6  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000216141  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3330  hypothetical protein  29.17 
 
 
149 aa  48.1  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0004  hypothetical protein  23.33 
 
 
97 aa  47  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.52078  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0005  hypothetical protein  27.91 
 
 
300 aa  47  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0643796  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1548  protein of unknown function DUF721  24.59 
 
 
160 aa  46.2  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0658767  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0004  protein of unknown function DUF721  28.57 
 
 
286 aa  44.3  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000131484  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2875  hypothetical protein  27.78 
 
 
162 aa  44.3  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0140441  hitchhiker  0.0000188483 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1777  hypothetical protein  28.24 
 
 
188 aa  43.1  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0004  hypothetical protein  27.71 
 
 
97 aa  42.4  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0004  hypothetical protein  23.33 
 
 
97 aa  42  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1258  hypothetical protein  26.58 
 
 
169 aa  41.6  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>