55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1433 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1433  Zn-ribbon-containing RNA-binding protein  100 
 
 		 156 aa  318  9.999999999999999e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0042  hypothetical protein  43.33 
 
 		 155 aa  140  5e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  36.64 
 
 		 196 aa  77.8  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  39.25 
 
 		 266 aa  75.5  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.221602  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0005  protein of unknown function DUF721  32.85 
 
 		 185 aa  73.9  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000106889 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  35.64 
 
 		 196 aa  74.3  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0005  hypothetical protein  35.96 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342856  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0004  protein of unknown function DUF721  35.45 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00476655  normal  0.0907524 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0004  protein of unknown function DUF721  37.98 
 
 		 184 aa  70.5  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0005  hypothetical protein  34.21 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0005  protein of unknown function DUF721  35.24 
 
 		 173 aa  68.2  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0013  hypothetical protein  34.21 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0008  protein of unknown function DUF721  33.61 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0005  hypothetical protein  34.21 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.935209  normal  0.0649143 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10004  hypothetical protein  36.19 
 
 		 187 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0005  hypothetical protein  35.14 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  0.25905 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0005  hypothetical protein  35.85 
 
 		 185 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731239  normal  0.310544 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  32.77 
 
 		 187 aa  67  0.00000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0005  protein of unknown function DUF721  39 
 
 		 188 aa  67  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0005  hypothetical protein  32.38 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0005  protein of unknown function DUF721  33.65 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0005  hypothetical protein  35.14 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0823  hypothetical protein  35.29 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0005  hypothetical protein  35.71 
 
 		 273 aa  64.7  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0987513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0005  protein of unknown function DUF721  34.29 
 
 		 217 aa  63.9  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382214 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0005  protein of unknown function DUF721  37.11 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00151548  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0005  protein of unknown function DUF721  30.53 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0006  hypothetical protein  33.59 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00159718  hitchhiker  0.00351653 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0005  protein of unknown function DUF721  31.3 
 
 		 207 aa  61.2  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0005  hypothetical protein  35.05 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000127236 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0004  hypothetical protein  34.38 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  34.48 
 
 		 217 aa  57.4  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00080644  normal  0.335319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0005  protein of unknown function DUF721  32.65 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.799003 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0006  Zn-ribbon-containing possibly RNA-binding protein and truncated derivatives-like protein  28.85 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0005  hypothetical protein  26.53 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0499719  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0005  protein of unknown function DUF721  31.13 
 
 		 171 aa  53.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0005  hypothetical protein  26.8 
 
 		 183 aa  53.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3436  hypothetical protein  38.1 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00123738  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3498  protein of unknown function DUF721  38.1 
 
 		 153 aa  51.6  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.68574e-33 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1777  hypothetical protein  28.07 
 
 		 188 aa  47  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0433  protein of unknown function DUF721  30.38 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000320142  unclonable  0.00000000000179401 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0419  hypothetical protein  30.38 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000551607  unclonable  0.00000388194 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0407  hypothetical protein  30.38 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171569  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3768  hypothetical protein  33.9 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00373156  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0493  hypothetical protein  32.91 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000306627  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0408  hypothetical protein  30.38 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390387  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3330  hypothetical protein  29.85 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2875  hypothetical protein  35.59 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0140441  hitchhiker  0.0000188483 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0587  hypothetical protein  27.27 
 
 		 173 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.683361  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0638  hypothetical protein  26.6 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.128267  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0095  hypothetical protein  34.04 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.437017  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0004  protein of unknown function DUF721  29.49 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0392  hypothetical protein  31.65 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000400952  unclonable  0.0000227076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3737  hypothetical protein  31.65 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000147329  hitchhiker  0.000000022613 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2487  hypothetical protein  24.14 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000990571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>