29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0587 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0587  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  348  2e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.683361  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1777  hypothetical protein  74.85 
 
 
188 aa  271  4.0000000000000004e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06201  hypothetical protein  60.23 
 
 
180 aa  223  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0388112 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04281  hypothetical protein  48.39 
 
 
176 aa  175  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1763  hypothetical protein  46.53 
 
 
160 aa  157  6e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.893095  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04851  hypothetical protein  47.1 
 
 
139 aa  154  4e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04871  hypothetical protein  35.42 
 
 
161 aa  127  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0908407  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0431  hypothetical protein  35.42 
 
 
152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04561  hypothetical protein  35.66 
 
 
153 aa  126  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04941  hypothetical protein  36.36 
 
 
160 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.67443  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0164  hypothetical protein  29.22 
 
 
185 aa  62  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0005  hypothetical protein  33.33 
 
 
134 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  0.25905 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0916  hypothetical protein  24.52 
 
 
185 aa  48.9  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5098  protein of unknown function DUF721  27.65 
 
 
178 aa  48.5  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0628947  normal  0.0645069 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0796  hypothetical protein  26.83 
 
 
181 aa  48.9  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4084  hypothetical protein  22.97 
 
 
184 aa  46.2  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00172895 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0005  hypothetical protein  30.77 
 
 
173 aa  46.2  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0499719  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2226  hypothetical protein  34.92 
 
 
168 aa  46.6  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000216141  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  29.63 
 
 
196 aa  45.4  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0005  protein of unknown function DUF721  29.73 
 
 
166 aa  45.1  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1572  protein of unknown function DUF721  25.88 
 
 
194 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1595  protein of unknown function DUF721  25.88 
 
 
194 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.215209 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0004  hypothetical protein  36.23 
 
 
164 aa  44.7  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  29.63 
 
 
266 aa  44.3  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.221602  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2350  hypothetical protein  30.34 
 
 
153 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000367866  normal  0.0123481 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3768  hypothetical protein  37.74 
 
 
152 aa  43.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00373156  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1433  Zn-ribbon-containing RNA-binding protein  27.27 
 
 
156 aa  42  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0004  protein of unknown function DUF721  34.25 
 
 
105 aa  41.6  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0005  protein of unknown function DUF721  26.97 
 
 
179 aa  41.2  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>