54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0005 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0005  protein of unknown function DUF721  100 
 
 		 166 aa  325  2.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0005  hypothetical protein  52.73 
 
 		 185 aa  155  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731239  normal  0.310544 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10004  hypothetical protein  54.89 
 
 		 187 aa  152  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0823  hypothetical protein  49.7 
 
 		 188 aa  150  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0005  hypothetical protein  49.09 
 
 		 190 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.935209  normal  0.0649143 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0005  hypothetical protein  49.09 
 
 		 190 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0013  hypothetical protein  49.09 
 
 		 190 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0005  hypothetical protein  49.69 
 
 		 188 aa  134  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0005  protein of unknown function DUF721  45.18 
 
 		 185 aa  132  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000106889 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0005  hypothetical protein  44.32 
 
 		 185 aa  132  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342856  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0008  protein of unknown function DUF721  48.98 
 
 		 180 aa  131  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  55.47 
 
 		 217 aa  129  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00080644  normal  0.335319 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  48.89 
 
 		 196 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0005  protein of unknown function DUF721  54.4 
 
 		 143 aa  125  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00151548  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0005  protein of unknown function DUF721  50.39 
 
 		 188 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0004  protein of unknown function DUF721  47.65 
 
 		 184 aa  122  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  48.55 
 
 		 196 aa  122  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  46.53 
 
 		 187 aa  122  3e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0005  protein of unknown function DUF721  50.37 
 
 		 217 aa  121  6e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382214 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0005  protein of unknown function DUF721  51.72 
 
 		 173 aa  120  9e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0005  hypothetical protein  47.73 
 
 		 134 aa  119  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  0.25905 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0005  hypothetical protein  45.51 
 
 		 183 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0005  hypothetical protein  43.95 
 
 		 273 aa  117  7.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0987513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0005  hypothetical protein  48.23 
 
 		 177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0006  hypothetical protein  55.12 
 
 		 198 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00159718  hitchhiker  0.00351653 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0006  Zn-ribbon-containing possibly RNA-binding protein and truncated derivatives-like protein  47.86 
 
 		 206 aa  110  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0005  hypothetical protein  48.24 
 
 		 201 aa  110  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000127236 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0005  protein of unknown function DUF721  46.83 
 
 		 207 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0004  hypothetical protein  42.62 
 
 		 164 aa  104  7e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0005  protein of unknown function DUF721  49.6 
 
 		 171 aa  100  6e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  42.52 
 
 		 266 aa  93.6  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.221602  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0005  protein of unknown function DUF721  37.14 
 
 		 179 aa  93.6  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0005  protein of unknown function DUF721  39.52 
 
 		 172 aa  89.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.799003 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0005  hypothetical protein  36.45 
 
 		 173 aa  81.6  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0499719  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0004  protein of unknown function DUF721  45.54 
 
 		 171 aa  78.6  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00476655  normal  0.0907524 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0042  hypothetical protein  30 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1433  Zn-ribbon-containing RNA-binding protein  33.65 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0005  protein of unknown function DUF721  32.63 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00444406 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0005  hypothetical protein  28.57 
 
 		 300 aa  51.6  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0643796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3498  protein of unknown function DUF721  25 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.68574e-33 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06201  hypothetical protein  29.67 
 
 		 180 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0388112 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0587  hypothetical protein  29.57 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.683361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0004  protein of unknown function DUF721  31.87 
 
 		 105 aa  45.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3436  hypothetical protein  25 
 
 		 151 aa  45.4  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00123738  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1777  hypothetical protein  29.82 
 
 		 188 aa  45.1  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0004  hypothetical protein  26.97 
 
 		 102 aa  43.9  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.301106  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3768  hypothetical protein  28.41 
 
 		 152 aa  43.9  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00373156  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1102  hypothetical protein  28.41 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000565832  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04281  hypothetical protein  26.45 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0095  Zn-ribbon-containing protein  25.29 
 
 		 101 aa  43.1  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142092  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2350  hypothetical protein  25.84 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000367866  normal  0.0123481 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2226  hypothetical protein  38.33 
 
 		 168 aa  43.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000216141  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0095  hypothetical protein  23.53 
 
 		 101 aa  41.6  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.437017  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3502  protein of unknown function DUF721  26.58 
 
 		 170 aa  40.8  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.428989 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>