70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3768 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3768  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  303  5.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00373156  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0638  hypothetical protein  51.37 
 
 		 159 aa  148  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.128267  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2875  hypothetical protein  51.68 
 
 		 162 aa  143  7.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0140441  hitchhiker  0.0000188483 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3436  hypothetical protein  45.16 
 
 		 151 aa  140  8e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00123738  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3498  protein of unknown function DUF721  45.33 
 
 		 153 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.68574e-33 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1102  hypothetical protein  43.36 
 
 		 155 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000565832  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2226  hypothetical protein  38.03 
 
 		 168 aa  99.4  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000216141  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2445  hypothetical protein  37.5 
 
 		 156 aa  87.4  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000048803  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3330  hypothetical protein  33.61 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0005  hypothetical protein  27.63 
 
 		 300 aa  64.3  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0643796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1548  protein of unknown function DUF721  33.58 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0658767  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0004  hypothetical protein  36.26 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10004  hypothetical protein  38.03 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0005  hypothetical protein  39.13 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731239  normal  0.310544 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0013  hypothetical protein  37.68 
 
 		 190 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0005  hypothetical protein  37.68 
 
 		 190 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0005  hypothetical protein  37.68 
 
 		 190 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.935209  normal  0.0649143 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0823  hypothetical protein  31.82 
 
 		 188 aa  57  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0005  hypothetical protein  35.16 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0004  hypothetical protein  40.32 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.132864 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0008  protein of unknown function DUF721  28.89 
 
 		 180 aa  53.9  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3502  protein of unknown function DUF721  26.35 
 
 		 170 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.428989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0005  protein of unknown function DUF721  44.83 
 
 		 172 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.799003 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0006  Zn-ribbon-containing possibly RNA-binding protein and truncated derivatives-like protein  30.39 
 
 		 206 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0005  hypothetical protein  40 
 
 		 173 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0499719  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0005  protein of unknown function DUF721  31.11 
 
 		 179 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5098  protein of unknown function DUF721  34.69 
 
 		 178 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0628947  normal  0.0645069 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0005  hypothetical protein  35.38 
 
 		 183 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0916  hypothetical protein  30.28 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0005  protein of unknown function DUF721  28.4 
 
 		 217 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382214 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0005  hypothetical protein  34.92 
 
 		 273 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0987513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2009  hypothetical protein  32.26 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1258  hypothetical protein  28.24 
 
 		 169 aa  48.9  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0005  protein of unknown function DUF721  35.53 
 
 		 188 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0005  hypothetical protein  32.5 
 
 		 134 aa  48.1  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  0.25905 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0004  hypothetical protein  34.92 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.52078  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5457  protein of unknown function DUF721  31.11 
 
 		 95 aa  47.8  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.010243  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0004  protein of unknown function DUF721  35.82 
 
 		 105 aa  47.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2350  hypothetical protein  31.08 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000367866  normal  0.0123481 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2709  protein of unknown function DUF721  29.58 
 
 		 106 aa  47  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0004  protein of unknown function DUF721  39.44 
 
 		 184 aa  47  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  28.41 
 
 		 266 aa  47  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.221602  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0095  Zn-ribbon-containing protein  35.94 
 
 		 101 aa  45.4  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142092  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  26.09 
 
 		 196 aa  45.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1621  hypothetical protein  31.25 
 
 		 287 aa  45.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.238182 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0164  hypothetical protein  35.94 
 
 		 185 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0005  hypothetical protein  35.38 
 
 		 185 aa  45.1  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342856  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0005  protein of unknown function DUF721  32.14 
 
 		 185 aa  44.3  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000106889 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0095  hypothetical protein  32.81 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.437017  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0005  hypothetical protein  37.29 
 
 		 188 aa  44.3  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  26.36 
 
 		 187 aa  43.9  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0544  hypothetical protein  30.77 
 
 		 86 aa  43.5  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000177054  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  32.39 
 
 		 196 aa  43.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0005  protein of unknown function DUF721  31.11 
 
 		 173 aa  43.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0005  hypothetical protein  27.14 
 
 		 201 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000127236 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0587  hypothetical protein  37.74 
 
 		 173 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.683361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0005  protein of unknown function DUF721  29.07 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1433  Zn-ribbon-containing RNA-binding protein  33.9 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0004  hypothetical protein  29.27 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10803  hypothetical protein  30.34 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.594174  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0216  protein of unknown function DUF721  25.29 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690778  normal  0.772545 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0005  protein of unknown function DUF721  33.72 
 
 		 143 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00151548  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1602  protein of unknown function DUF721  26.35 
 
 		 168 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0552613 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0042  hypothetical protein  38.98 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0006  hypothetical protein  27.14 
 
 		 198 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00159718  hitchhiker  0.00351653 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1777  hypothetical protein  32.08 
 
 		 188 aa  41.2  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0005  protein of unknown function DUF721  30.83 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.478726  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3136  hypothetical protein  32.76 
 
 		 175 aa  41.2  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2563  protein of unknown function DUF721  32.08 
 
 		 178 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0003  hypothetical protein  29.67 
 
 		 97 aa  40  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.179596  normal  0.528651 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>