65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3330 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3330  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  302  1.0000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3768  hypothetical protein  33.61 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00373156  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3436  hypothetical protein  34.92 
 
 		 151 aa  72  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00123738  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0638  hypothetical protein  34.13 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.128267  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3498  protein of unknown function DUF721  34.71 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.68574e-33 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2875  hypothetical protein  33.6 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0140441  hitchhiker  0.0000188483 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1548  protein of unknown function DUF721  30.77 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0658767  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2226  hypothetical protein  31.78 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000216141  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2445  hypothetical protein  35.77 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000048803  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1102  hypothetical protein  32.17 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000565832  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0164  hypothetical protein  38.16 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0005  hypothetical protein  37.1 
 
 		 201 aa  53.9  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000127236 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0916  hypothetical protein  32.08 
 
 		 185 aa  53.9  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0006  hypothetical protein  37.1 
 
 		 198 aa  53.5  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00159718  hitchhiker  0.00351653 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0005  protein of unknown function DUF721  37.68 
 
 		 179 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3502  protein of unknown function DUF721  34.23 
 
 		 170 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.428989 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2350  hypothetical protein  30.3 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000367866  normal  0.0123481 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0005  protein of unknown function DUF721  43.64 
 
 		 172 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.799003 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0747  hypothetical protein  28.48 
 
 		 171 aa  51.6  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.301449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0003  hypothetical protein  37.7 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.179596  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0823  hypothetical protein  28.05 
 
 		 188 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0005  hypothetical protein  24.62 
 
 		 300 aa  50.1  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0643796  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0005  hypothetical protein  31.76 
 
 		 183 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0005  hypothetical protein  29.17 
 
 		 185 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731239  normal  0.310544 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0013  hypothetical protein  30.43 
 
 		 190 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0005  hypothetical protein  30.43 
 
 		 190 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.935209  normal  0.0649143 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0005  hypothetical protein  30.43 
 
 		 190 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  36.92 
 
 		 196 aa  48.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0004  hypothetical protein  31.76 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.52078  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2009  hypothetical protein  32 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0544  hypothetical protein  33.8 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000177054  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0004  hypothetical protein  38.1 
 
 		 97 aa  47.8  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0005  hypothetical protein  32.47 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  0.25905 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0042  hypothetical protein  35.38 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10004  hypothetical protein  29.58 
 
 		 187 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0055  protein of unknown function DUF721  28.23 
 
 		 271 aa  45.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1171  hypothetical protein  27.08 
 
 		 186 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1595  protein of unknown function DUF721  30.95 
 
 		 194 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.215209 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1572  protein of unknown function DUF721  30.95 
 
 		 194 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0006  Zn-ribbon-containing possibly RNA-binding protein and truncated derivatives-like protein  33.33 
 
 		 206 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0095  Zn-ribbon-containing protein  33.33 
 
 		 101 aa  45.4  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142092  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0005  protein of unknown function DUF721  33.33 
 
 		 207 aa  45.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0095  hypothetical protein  31.82 
 
 		 101 aa  45.1  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.437017  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0612  protein of unknown function DUF721  31.75 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0004  protein of unknown function DUF721  30.88 
 
 		 105 aa  43.5  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1433  Zn-ribbon-containing RNA-binding protein  29.85 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  30.3 
 
 		 196 aa  42.7  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2709  protein of unknown function DUF721  30.88 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0005  hypothetical protein  38.46 
 
 		 273 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0987513  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10803  hypothetical protein  29.82 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.594174  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0004  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.132864 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0005  hypothetical protein  35.38 
 
 		 185 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342856  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5098  protein of unknown function DUF721  32.41 
 
 		 178 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0628947  normal  0.0645069 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1602  protein of unknown function DUF721  26.06 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0552613 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2033  protein of unknown function DUF1159  32.93 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0187777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2995  hypothetical protein  31.43 
 
 		 266 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.333747  normal  0.629228 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0041  protein of unknown function DUF721  28.12 
 
 		 176 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.379722  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0004  hypothetical protein  36.07 
 
 		 102 aa  42  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.301106  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0005  hypothetical protein  33.33 
 
 		 173 aa  42  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0499719  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0005  protein of unknown function DUF721  31.88 
 
 		 185 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000106889 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0005  protein of unknown function DUF721  28.57 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0004  hypothetical protein  30 
 
 		 164 aa  41.2  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0005  hypothetical protein  32.73 
 
 		 188 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1613  protein of unknown function DUF721  44.26 
 
 		 190 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00599305 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  34.78 
 
 		 217 aa  40  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00080644  normal  0.335319 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>