52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_00050 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  100 
 
 		 217 aa  429  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00080644  normal  0.335319 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0005  hypothetical protein  55.31 
 
 		 190 aa  177  8e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0005  hypothetical protein  55.31 
 
 		 190 aa  177  8e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.935209  normal  0.0649143 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0013  hypothetical protein  55.31 
 
 		 190 aa  177  8e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10004  hypothetical protein  65.12 
 
 		 187 aa  177  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0005  hypothetical protein  53.71 
 
 		 185 aa  169  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731239  normal  0.310544 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0008  protein of unknown function DUF721  58.45 
 
 		 180 aa  164  9e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0823  hypothetical protein  53.18 
 
 		 188 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0005  protein of unknown function DUF721  64.8 
 
 		 143 aa  154  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00151548  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0004  protein of unknown function DUF721  59.54 
 
 		 184 aa  150  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0005  protein of unknown function DUF721  55.47 
 
 		 166 aa  145  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0005  protein of unknown function DUF721  52.08 
 
 		 188 aa  137  7.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0006  hypothetical protein  48.53 
 
 		 198 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00159718  hitchhiker  0.00351653 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0005  protein of unknown function DUF721  43.33 
 
 		 185 aa  131  9e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000106889 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0005  hypothetical protein  49.62 
 
 		 188 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0005  protein of unknown function DUF721  51.26 
 
 		 173 aa  129  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0005  hypothetical protein  42.46 
 
 		 185 aa  128  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342856  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0005  hypothetical protein  49.61 
 
 		 134 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  0.25905 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  50.38 
 
 		 196 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0005  protein of unknown function DUF721  47.18 
 
 		 217 aa  124  9e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382214 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0005  hypothetical protein  57.38 
 
 		 201 aa  124  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000127236 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0005  hypothetical protein  47.41 
 
 		 273 aa  122  5e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0987513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  38.81 
 
 		 196 aa  121  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0005  hypothetical protein  46.38 
 
 		 177 aa  118  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  50.42 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0005  protein of unknown function DUF721  45.3 
 
 		 207 aa  108  7.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0005  hypothetical protein  46.15 
 
 		 183 aa  105  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0004  hypothetical protein  43.97 
 
 		 164 aa  105  6e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0005  protein of unknown function DUF721  41.83 
 
 		 179 aa  102  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0006  Zn-ribbon-containing possibly RNA-binding protein and truncated derivatives-like protein  43.33 
 
 		 206 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  44.09 
 
 		 266 aa  98.6  7e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.221602  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0005  protein of unknown function DUF721  44.09 
 
 		 171 aa  93.6  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0004  protein of unknown function DUF721  45 
 
 		 171 aa  87  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00476655  normal  0.0907524 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0005  hypothetical protein  40.43 
 
 		 173 aa  84.3  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0499719  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0005  protein of unknown function DUF721  38.94 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.799003 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0042  hypothetical protein  35.58 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0005  protein of unknown function DUF721  37.23 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00444406 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1433  Zn-ribbon-containing RNA-binding protein  34.48 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3436  hypothetical protein  34.04 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00123738  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3498  protein of unknown function DUF721  34.04 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.68574e-33 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3330  hypothetical protein  34.78 
 
 		 149 aa  49.7  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3768  hypothetical protein  31.51 
 
 		 152 aa  49.7  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00373156  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2875  hypothetical protein  30.84 
 
 		 162 aa  49.3  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0140441  hitchhiker  0.0000188483 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0638  hypothetical protein  30.39 
 
 		 159 aa  49.3  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.128267  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1102  hypothetical protein  31.87 
 
 		 155 aa  48.1  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000565832  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0005  hypothetical protein  25.33 
 
 		 300 aa  46.2  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0643796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0004  protein of unknown function DUF721  30.43 
 
 		 105 aa  46.2  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04281  hypothetical protein  26.27 
 
 		 176 aa  45.1  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2009  hypothetical protein  25.56 
 
 		 97 aa  45.1  0.0009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2226  hypothetical protein  28.77 
 
 		 168 aa  44.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000216141  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0544  hypothetical protein  35.48 
 
 		 86 aa  43.5  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000177054  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04871  hypothetical protein  24.1 
 
 		 161 aa  41.6  0.01  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0908407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>