29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2709 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2709  protein of unknown function DUF721  100 
 
 
106 aa  217  5e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0216  protein of unknown function DUF721  48.08 
 
 
108 aa  122  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690778  normal  0.772545 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0535  protein of unknown function DUF721  43.16 
 
 
96 aa  92.4  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.864734  hitchhiker  0.0000000114959 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3716  hypothetical protein  36.84 
 
 
105 aa  89  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.290608 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4977  hypothetical protein  34.38 
 
 
98 aa  65.5  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5457  protein of unknown function DUF721  30.43 
 
 
95 aa  60.8  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.010243  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0612  protein of unknown function DUF721  34.09 
 
 
96 aa  60.1  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0004  hypothetical protein  32.86 
 
 
96 aa  54.7  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.132864 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2691  protein of unknown function DUF721  25.27 
 
 
95 aa  54.3  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0645  hypothetical protein  22.47 
 
 
97 aa  53.1  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.361881 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10803  hypothetical protein  31.76 
 
 
98 aa  52.4  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.594174  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0004  hypothetical protein  27.84 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3768  hypothetical protein  29.58 
 
 
152 aa  47  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00373156  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2009  hypothetical protein  33.78 
 
 
97 aa  46.2  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0638  hypothetical protein  31.88 
 
 
159 aa  45.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.128267  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0005  hypothetical protein  25.96 
 
 
273 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0987513  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1548  protein of unknown function DUF721  24.05 
 
 
160 aa  43.9  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0658767  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2417  hypothetical protein  25.88 
 
 
128 aa  43.5  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1102  hypothetical protein  22.73 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000565832  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3330  hypothetical protein  30.88 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3502  protein of unknown function DUF721  29.55 
 
 
170 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.428989 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0003  hypothetical protein  27.37 
 
 
97 aa  42  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.179596  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0004  hypothetical protein  24.69 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.52078  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0095  hypothetical protein  27.69 
 
 
101 aa  41.2  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.437017  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3436  hypothetical protein  25.53 
 
 
151 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00123738  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0095  Zn-ribbon-containing protein  27.69 
 
 
101 aa  40.8  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142092  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0005  hypothetical protein  24.55 
 
 
177 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3498  protein of unknown function DUF721  25.53 
 
 
153 aa  40.4  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.68574e-33 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0005  hypothetical protein  26.51 
 
 
134 aa  40  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  0.25905 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>