36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3502 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3502  protein of unknown function DUF721  100 
 
 		 170 aa  328  2e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.428989 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  33.33 
 
 		 196 aa  57.8  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0004  hypothetical protein  31.68 
 
 		 102 aa  57  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.301106  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2009  hypothetical protein  32.98 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0638  hypothetical protein  34.12 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.128267  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0055  protein of unknown function DUF721  30.92 
 
 		 271 aa  55.1  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0004  hypothetical protein  32.56 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.52078  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3768  hypothetical protein  26.35 
 
 		 152 aa  53.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00373156  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0006  Zn-ribbon-containing possibly RNA-binding protein and truncated derivatives-like protein  35.9 
 
 		 206 aa  52.4  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1102  hypothetical protein  31.18 
 
 		 155 aa  52.4  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000565832  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2875  hypothetical protein  29.53 
 
 		 162 aa  52  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0140441  hitchhiker  0.0000188483 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2995  hypothetical protein  31.87 
 
 		 266 aa  51.2  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.333747  normal  0.629228 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0005  protein of unknown function DUF721  27.71 
 
 		 185 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000106889 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3436  hypothetical protein  24.68 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00123738  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0004  hypothetical protein  34.62 
 
 		 97 aa  48.9  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0003  hypothetical protein  31.25 
 
 		 97 aa  48.5  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.179596  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0004  hypothetical protein  27.96 
 
 		 96 aa  48.9  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.132864 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2445  hypothetical protein  31.2 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000048803  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0005  hypothetical protein  35.82 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2226  hypothetical protein  26.25 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000216141  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1621  hypothetical protein  33.33 
 
 		 287 aa  47.4  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.238182 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0005  hypothetical protein  26.67 
 
 		 134 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  0.25905 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0005  hypothetical protein  25.29 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342856  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3330  hypothetical protein  38.46 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3498  protein of unknown function DUF721  26.6 
 
 		 153 aa  46.6  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.68574e-33 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  26.67 
 
 		 187 aa  46.2  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1548  protein of unknown function DUF721  25.37 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0658767  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0005  hypothetical protein  32.67 
 
 		 188 aa  45.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0005  hypothetical protein  21.54 
 
 		 300 aa  45.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0643796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0004  hypothetical protein  29.17 
 
 		 164 aa  45.1  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2709  protein of unknown function DUF721  29.55 
 
 		 106 aa  42.4  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0164  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  42  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0004  protein of unknown function DUF721  32.18 
 
 		 171 aa  42  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00476655  normal  0.0907524 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0005  protein of unknown function DUF721  31.65 
 
 		 179 aa  41.6  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2350  hypothetical protein  27.56 
 
 		 153 aa  40.8  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000367866  normal  0.0123481 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0005  hypothetical protein  29.07 
 
 		 185 aa  40.8  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731239  normal  0.310544 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>