160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_03440 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_03440  periplasmic serine protease (ClpP class)  100 
 
 		 268 aa  539  9.999999999999999e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1781  hypothetical protein  66.29 
 
 		 276 aa  352  5e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0215  protein of unknown function DUF114  63.26 
 
 		 278 aa  352  5e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0321874  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3527  protein of unknown function DUF114  60.53 
 
 		 275 aa  345  4e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1334  protein of unknown function DUF114  61.36 
 
 		 280 aa  342  4e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.611057  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0011  hypothetical protein  60.54 
 
 		 284 aa  334  1e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0011  hypothetical protein  60.92 
 
 		 284 aa  333  1e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2943  hypothetical protein  59.47 
 
 		 279 aa  331  7.000000000000001e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3097  hypothetical protein  59.85 
 
 		 282 aa  328  5.0000000000000004e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645048 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0404  protein of unknown function DUF114  58.78 
 
 		 280 aa  328  7e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2297  protein of unknown function DUF114  57.63 
 
 		 286 aa  327  9e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1552  hypothetical protein  57.63 
 
 		 279 aa  324  8.000000000000001e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238673 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0335  hypothetical protein  56.82 
 
 		 281 aa  323  3e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0491521  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11070  periplasmic serine protease (ClpP class)  65.4 
 
 		 265 aa  316  3e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000898783  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1401  protein of unknown function DUF114  57.36 
 
 		 277 aa  315  3e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.129163  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1020  hypothetical protein  53.96 
 
 		 274 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3319  hypothetical protein  54.17 
 
 		 278 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1299  protein of unknown function DUF114  55.6 
 
 		 277 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.856082  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0926  hypothetical protein  53.58 
 
 		 274 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1198  hypothetical protein  58.47 
 
 		 283 aa  301  7.000000000000001e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1661  hypothetical protein  53.21 
 
 		 274 aa  299  3e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1139  hypothetical protein  58.05 
 
 		 272 aa  299  3e-80  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1233  hypothetical protein  56.35 
 
 		 292 aa  299  3e-80  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.17311  normal  0.434623 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1874  hypothetical protein  53.79 
 
 		 297 aa  291  6e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.923248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2712  protein of unknown function DUF114  54.55 
 
 		 269 aa  290  2e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4766  protein of unknown function DUF114  58.78 
 
 		 296 aa  288  6e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0583634  hitchhiker  0.000468876 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7800  hypothetical protein  54.15 
 
 		 276 aa  287  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0202  protein of unknown function DUF114  56.63 
 
 		 283 aa  285  4e-76  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0381  hypothetical protein  52.82 
 
 		 276 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.824542  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0558  protein of unknown function DUF114  55 
 
 		 283 aa  279  3e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0678  hypothetical protein  50 
 
 		 279 aa  271  7e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1537  hypothetical protein  51.57 
 
 		 301 aa  267  1e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.675779  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3600  hypothetical protein  38.91 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.354038  normal  0.0141904 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2112  hypothetical protein  30.04 
 
 		 350 aa  103  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.492379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3172  protein of unknown function DUF114  29.77 
 
 		 328 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.601853  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0878  hypothetical protein  28.84 
 
 		 338 aa  80.1  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000902689  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3471  protein of unknown function DUF114  26.4 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3424  protein of unknown function DUF114  36.78 
 
 		 339 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3346  protein of unknown function DUF114  29.05 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106769  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1836  hypothetical protein  25.87 
 
 		 354 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2773  hypothetical protein  40 
 
 		 323 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0940  hypothetical protein  24.68 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2861  protein of unknown function DUF114  26.7 
 
 		 336 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1629  R2.LlaJI  24.88 
 
 		 349 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0248162  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4091  hypothetical protein  23.73 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0527  peptidase S49  23.89 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585752  normal  0.703911 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4681  hypothetical protein  33.71 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214959  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0571  peptidase S49  24.55 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3727  hypothetical protein  29.17 
 
 		 354 aa  53.5  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.175021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0626  peptidase S14 ClpP  38.36 
 
 		 244 aa  52.4  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0396  protease IV, putative  23.64 
 
 		 368 aa  52.4  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.690183  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0405  putative protease IV  23.64 
 
 		 368 aa  52.4  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1874  peptidase S14, ClpP  35.16 
 
 		 361 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0947  proteinase sohB  27.05 
 
 		 288 aa  52  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.328239  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  45.76 
 
 		 620 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0461  peptidase S49  26.98 
 
 		 288 aa  50.4  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.361729 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0514  peptidase S49  23.76 
 
 		 290 aa  50.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2771  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.43 
 
 		 584 aa  49.7  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4351  peptidase S49  28.3 
 
 		 302 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.244861  hitchhiker  0.00437217 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4476  hypothetical protein  38.6 
 
 		 70 aa  49.3  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1190  protein of unknown function DUF107  36.71 
 
 		 447 aa  49.3  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00806251  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1521  signal peptide peptidase A  30 
 
 		 316 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2353  putative serine protease SohB  23.71 
 
 		 283 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.169927 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0841  putative periplasmic protease  25.47 
 
 		 347 aa  47.8  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0227554  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3597  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.56 
 
 		 640 aa  47.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1223  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.35 
 
 		 590 aa  47.8  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000375913  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2929  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.76 
 
 		 324 aa  47.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.359605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0385  S49 family peptidase  24.1 
 
 		 283 aa  47.4  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0130  peptidase S49  27.78 
 
 		 306 aa  47  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.14674  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.18 
 
 		 633 aa  47  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3916  1,4-dihydroxy-2-naphthoate synthase  34.15 
 
 		 260 aa  46.6  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  27.21 
 
 		 608 aa  46.2  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2434  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.41 
 
 		 382 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270678  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2346  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.41 
 
 		 382 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1542  naphthoate synthase  35.37 
 
 		 260 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.04426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2605  peptidase S14, ClpP  26.32 
 
 		 258 aa  46.2  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0963  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.93 
 
 		 547 aa  46.2  0.0006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5841  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.77 
 
 		 587 aa  45.8  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1033  naphthoate synthase  34.15 
 
 		 260 aa  45.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1143  ATP-dependent protease  36.07 
 
 		 683 aa  45.8  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2501  peptidase S14 ClpP  36.62 
 
 		 280 aa  45.8  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0232282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1718  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.53 
 
 		 585 aa  45.8  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0720  2-ketocyclohexanecarboxyl-CoA hydrolase  34.15 
 
 		 260 aa  45.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2299  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.4 
 
 		 613 aa  45.8  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000354581  normal  0.336297 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.33 
 
 		 371 aa  45.8  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1071  ATP-dependent protease  36.07 
 
 		 684 aa  45.4  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.146018  hitchhiker  0.00123703 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1408  ATP-dependent protease  36.07 
 
 		 684 aa  45.4  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104115  hitchhiker  0.000644227 
 
 
-
 
NC_002936  DET1086  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP, putative  32.84 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1759  peptidase S49  38.81 
 
 		 356 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.257491  normal  0.0518499 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0608  naphthoate synthase  29.73 
 
 		 285 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1720  peptidase S14, ClpP  34.85 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3971  peptidase S14, ClpP  35.82 
 
 		 216 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.269828 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2220  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.23 
 
 		 323 aa  45.4  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.205102  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2311  acid phosphatase  31.4 
 
 		 612 aa  45.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000317657  hitchhiker  0.000195822 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2235  protease IV  32.18 
 
 		 633 aa  45.4  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04043  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.56 
 
 		 629 aa  45.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2389  peptidase S14, ClpP  26.89 
 
 		 351 aa  44.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.142476  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2844  serine protease, ClpP class  34.94 
 
 		 407 aa  44.3  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1941  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.4 
 
 		 613 aa  44.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0528777  normal  0.0163156 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2857  peptidase S49  25.64 
 
 		 265 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>