98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0381 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0381  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  552  1e-156  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.824542  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1334  protein of unknown function DUF114  57.88 
 
 		 280 aa  331  8e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.611057  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3527  protein of unknown function DUF114  59.32 
 
 		 275 aa  322  4e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0404  protein of unknown function DUF114  57.35 
 
 		 280 aa  322  4e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0215  protein of unknown function DUF114  58.3 
 
 		 278 aa  321  9.999999999999999e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0321874  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1552  hypothetical protein  58.39 
 
 		 279 aa  319  3e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238673 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2943  hypothetical protein  60.4 
 
 		 279 aa  319  3e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3097  hypothetical protein  59.92 
 
 		 282 aa  317  1e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645048 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2297  protein of unknown function DUF114  60.62 
 
 		 286 aa  317  2e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0011  hypothetical protein  54.04 
 
 		 284 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1781  hypothetical protein  59.92 
 
 		 276 aa  313  1.9999999999999998e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0011  hypothetical protein  53.68 
 
 		 284 aa  310  2e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3319  hypothetical protein  59.84 
 
 		 278 aa  308  9e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1874  hypothetical protein  56.13 
 
 		 297 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.923248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1020  hypothetical protein  52.27 
 
 		 274 aa  305  6e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0926  hypothetical protein  52.65 
 
 		 274 aa  304  9.000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1661  hypothetical protein  52.65 
 
 		 274 aa  304  9.000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1198  hypothetical protein  54.13 
 
 		 283 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1139  hypothetical protein  53.91 
 
 		 272 aa  301  5.000000000000001e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1299  protein of unknown function DUF114  55.11 
 
 		 277 aa  298  7e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.856082  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0335  hypothetical protein  55.91 
 
 		 281 aa  297  2e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0491521  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1401  protein of unknown function DUF114  56.11 
 
 		 277 aa  294  1e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.129163  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4766  protein of unknown function DUF114  58.54 
 
 		 296 aa  288  8e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0583634  hitchhiker  0.000468876 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2712  protein of unknown function DUF114  51.49 
 
 		 269 aa  286  2e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03440  periplasmic serine protease (ClpP class)  50.76 
 
 		 268 aa  286  2.9999999999999996e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7800  hypothetical protein  52.71 
 
 		 276 aa  280  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1233  hypothetical protein  54.92 
 
 		 292 aa  276  2e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.17311  normal  0.434623 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11070  periplasmic serine protease (ClpP class)  53.16 
 
 		 265 aa  272  5.000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000898783  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0202  protein of unknown function DUF114  47.71 
 
 		 283 aa  262  4.999999999999999e-69  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0558  protein of unknown function DUF114  49.43 
 
 		 283 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0678  hypothetical protein  51.7 
 
 		 279 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1537  hypothetical protein  46.88 
 
 		 301 aa  223  2e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.675779  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3600  hypothetical protein  40.47 
 
 		 272 aa  191  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.354038  normal  0.0141904 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2112  hypothetical protein  30.58 
 
 		 350 aa  100  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.492379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3471  protein of unknown function DUF114  34.86 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3346  protein of unknown function DUF114  27.8 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106769  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3172  protein of unknown function DUF114  25.19 
 
 		 328 aa  66.6  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.601853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3424  protein of unknown function DUF114  32.61 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4091  hypothetical protein  28.26 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0940  hypothetical protein  41.56 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2773  hypothetical protein  31.47 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  35.44 
 
 		 620 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0878  hypothetical protein  23.83 
 
 		 338 aa  56.2  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000902689  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1874  peptidase S14, ClpP  35.48 
 
 		 361 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0626  peptidase S14 ClpP  28.93 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3971  peptidase S14, ClpP  35.37 
 
 		 216 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.269828 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2861  protein of unknown function DUF114  23.71 
 
 		 336 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3727  hypothetical protein  37.88 
 
 		 354 aa  49.3  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.175021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1836  hypothetical protein  26.82 
 
 		 354 aa  48.1  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2853  peptidase S14 ClpP  29.46 
 
 		 564 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12086  normal  0.0147966 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2353  putative serine protease SohB  24.54 
 
 		 283 aa  47  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.169927 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1326  hypothetical protein  36.23 
 
 		 388 aa  46.6  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4681  hypothetical protein  33.75 
 
 		 338 aa  46.2  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3213  peptidase S49  34.18 
 
 		 293 aa  46.2  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00577792  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  28 
 
 		 1156 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0947  proteinase sohB  34.62 
 
 		 288 aa  45.8  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.328239  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1864  Clp protease domain protein  28 
 
 		 651 aa  45.8  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657309 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3202  Clp protease domain protein  28 
 
 		 651 aa  45.8  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.790281  hitchhiker  0.00227439 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0730  protein of unknown function DUF107  33.77 
 
 		 828 aa  45.8  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.553992  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0396  protease IV, putative  28.93 
 
 		 368 aa  45.8  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.690183  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0405  putative protease IV  28.93 
 
 		 368 aa  45.8  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1190  protein of unknown function DUF107  38.33 
 
 		 447 aa  45.4  0.0009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00806251  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0527  peptidase S49  25.5 
 
 		 286 aa  45.4  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585752  normal  0.703911 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1629  R2.LlaJI  25.7 
 
 		 349 aa  45.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0248162  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0900  Clp protease domain protein  27.27 
 
 		 652 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0708  peptidase S49  30.53 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.884772  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2857  peptidase S49  32.47 
 
 		 265 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0660  Clp protease  25.15 
 
 		 248 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0514  peptidase S49  35.14 
 
 		 290 aa  45.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2389  peptidase S14, ClpP  33.75 
 
 		 351 aa  45.4  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.142476  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2253  peptidase S14, ClpP  34.07 
 
 		 674 aa  45.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0288659 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0461  peptidase S49  26.79 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.361729 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0571  peptidase S49  32.94 
 
 		 286 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1076  S49 family peptidase  35.06 
 
 		 265 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1720  peptidase S14, ClpP  30.51 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2771  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.75 
 
 		 584 aa  43.9  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2737  peptidase S49  35.06 
 
 		 265 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.224887  normal  0.140523 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2844  serine protease, ClpP class  33.33 
 
 		 407 aa  43.9  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2190  peptidase S14, ClpP  30.86 
 
 		 688 aa  43.9  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000592191 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3866  peptidase S14 ClpP  37.29 
 
 		 280 aa  43.1  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220297 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7330  peptidase S14 ClpP  33.33 
 
 		 237 aa  43.5  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.307077  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1378  Clp protease  25 
 
 		 247 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00455608 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2589  peptidase S49  34.85 
 
 		 292 aa  43.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.901075  normal  0.113657 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.53 
 
 		 325 aa  43.5  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2220  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.67 
 
 		 323 aa  43.5  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.205102  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1421  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.25 
 
 		 326 aa  43.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000360798  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0385  S49 family peptidase  24.71 
 
 		 283 aa  43.1  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3590  peptidase S14 ClpP  25.75 
 
 		 247 aa  43.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.226439  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2605  peptidase S14, ClpP  27.71 
 
 		 258 aa  42.7  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0695  ATP-dependent protease  35.59 
 
 		 689 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.265261  hitchhiker  0.00014029 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1046  ClpP protease  38.18 
 
 		 280 aa  42.7  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304732  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4351  peptidase S49  31.25 
 
 		 302 aa  42.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.244861  hitchhiker  0.00437217 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3916  1,4-dihydroxy-2-naphthoate synthase  34.15 
 
 		 260 aa  42.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1408  ATP-dependent protease  32.31 
 
 		 684 aa  42.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104115  hitchhiker  0.000644227 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1071  ATP-dependent protease  32.31 
 
 		 684 aa  42.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.146018  hitchhiker  0.00123703 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1143  ATP-dependent protease  32.31 
 
 		 683 aa  42.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1376  peptidase S49  26.98 
 
 		 295 aa  42.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3297  peptidase S49  28.57 
 
 		 286 aa  42  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.49449 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>