100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0558 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0558  protein of unknown function DUF114  100 
 
 		 283 aa  577  1e-164  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0202  protein of unknown function DUF114  60.24 
 
 		 283 aa  314  9.999999999999999e-85  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3527  protein of unknown function DUF114  59.32 
 
 		 275 aa  305  4.0000000000000004e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0011  hypothetical protein  54.95 
 
 		 284 aa  297  1e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0404  protein of unknown function DUF114  58.21 
 
 		 280 aa  296  2e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1552  hypothetical protein  58.58 
 
 		 279 aa  296  2e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238673 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0011  hypothetical protein  54.95 
 
 		 284 aa  295  7e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1401  protein of unknown function DUF114  54.75 
 
 		 277 aa  293  2e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.129163  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3097  hypothetical protein  56.04 
 
 		 282 aa  290  1e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645048 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2943  hypothetical protein  57.3 
 
 		 279 aa  291  1e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1334  protein of unknown function DUF114  55.51 
 
 		 280 aa  290  2e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.611057  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0215  protein of unknown function DUF114  55.76 
 
 		 278 aa  289  4e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0321874  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2297  protein of unknown function DUF114  54.18 
 
 		 286 aa  287  1e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7800  hypothetical protein  54.51 
 
 		 276 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1299  protein of unknown function DUF114  53.38 
 
 		 277 aa  281  6.000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.856082  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3319  hypothetical protein  54.17 
 
 		 278 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03440  periplasmic serine protease (ClpP class)  55 
 
 		 268 aa  279  3e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1020  hypothetical protein  52.83 
 
 		 274 aa  276  3e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1661  hypothetical protein  52.45 
 
 		 274 aa  276  4e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0678  hypothetical protein  54.44 
 
 		 279 aa  275  6e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1781  hypothetical protein  52.73 
 
 		 276 aa  275  6e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1874  hypothetical protein  51.84 
 
 		 297 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.923248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0926  hypothetical protein  52.11 
 
 		 274 aa  270  2e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0335  hypothetical protein  50.76 
 
 		 281 aa  268  5.9999999999999995e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0491521  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1233  hypothetical protein  54.58 
 
 		 292 aa  266  2e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.17311  normal  0.434623 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2712  protein of unknown function DUF114  50.95 
 
 		 269 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4766  protein of unknown function DUF114  52.11 
 
 		 296 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0583634  hitchhiker  0.000468876 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1198  hypothetical protein  55.42 
 
 		 283 aa  257  1e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11070  periplasmic serine protease (ClpP class)  51.43 
 
 		 265 aa  257  2e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000898783  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1139  hypothetical protein  51.95 
 
 		 272 aa  255  5e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0381  hypothetical protein  50.39 
 
 		 276 aa  249  4e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.824542  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1537  hypothetical protein  51.56 
 
 		 301 aa  246  3e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.675779  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3600  hypothetical protein  44.14 
 
 		 272 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.354038  normal  0.0141904 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2112  hypothetical protein  34.87 
 
 		 350 aa  92.8  6e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.492379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3471  protein of unknown function DUF114  30.47 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3424  protein of unknown function DUF114  32.52 
 
 		 339 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2861  protein of unknown function DUF114  26.47 
 
 		 336 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4091  hypothetical protein  32.82 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3172  protein of unknown function DUF114  30 
 
 		 328 aa  59.3  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.601853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0940  hypothetical protein  32.08 
 
 		 330 aa  57  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4681  hypothetical protein  34.07 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214959  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2773  hypothetical protein  30.94 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3727  hypothetical protein  28.32 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.175021  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0878  hypothetical protein  23.67 
 
 		 338 aa  54.7  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000902689  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1836  hypothetical protein  25.32 
 
 		 354 aa  53.5  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3346  protein of unknown function DUF114  26.19 
 
 		 258 aa  52.4  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106769  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1629  R2.LlaJI  29.57 
 
 		 349 aa  51.6  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0248162  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1720  peptidase S14, ClpP  38.1 
 
 		 247 aa  50.8  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0626  peptidase S14 ClpP  31.3 
 
 		 244 aa  50.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0841  putative periplasmic protease  30.89 
 
 		 347 aa  49.3  0.00008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0227554  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1193  protein of unknown function DUF107  35 
 
 		 458 aa  48.9  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0874985  normal  0.16265 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2771  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.95 
 
 		 584 aa  48.1  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2659  putative periplasmic protease  37.5 
 
 		 348 aa  47  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0477819  unclonable  0.0000000288065 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3597  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.05 
 
 		 640 aa  46.6  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0514  peptidase S49  33.71 
 
 		 290 aa  46.6  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1759  peptidase S49  39.44 
 
 		 356 aa  46.6  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.257491  normal  0.0518499 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1941  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.88 
 
 		 613 aa  46.2  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0528777  normal  0.0163156 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1926  putative periplasmic protease  36.9 
 
 		 348 aa  45.8  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0405  putative protease IV  41.94 
 
 		 368 aa  45.8  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2314  putative periplasmic protease  34.38 
 
 		 348 aa  45.8  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0396  protease IV, putative  41.94 
 
 		 368 aa  45.8  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.690183  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1925  putative periplasmic protease  38.71 
 
 		 348 aa  45.8  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0571162  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2306  putative periplasmic protease  38.71 
 
 		 348 aa  45.8  0.0009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2036  putative periplasmic protease  38.71 
 
 		 348 aa  45.8  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.210716  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2013  putative periplasmic protease  34.38 
 
 		 348 aa  45.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0439516  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5841  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.96 
 
 		 587 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2128  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.07 
 
 		 604 aa  45.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2166  putative periplasmic protease  35.71 
 
 		 348 aa  44.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0622193  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1223  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.73 
 
 		 590 aa  44.3  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000375913  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0730  protein of unknown function DUF107  36.51 
 
 		 828 aa  44.3  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.553992  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2377  Peptidase S49 domain protein  36.9 
 
 		 349 aa  44.3  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00026529  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4476  hypothetical protein  43.4 
 
 		 70 aa  44.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1381  putative periplasmic protease  36.9 
 
 		 349 aa  44.3  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1471  putative periplasmic protease  36.9 
 
 		 349 aa  44.3  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.251936  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1904  putative periplasmic protease  36.9 
 
 		 349 aa  44.3  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000180069 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01248  predicted inner membrane peptidase  36.9 
 
 		 349 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.57179  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2356  putative periplasmic protease  36.9 
 
 		 349 aa  44.3  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.203735  hitchhiker  0.000000387336 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1859  putative periplasmic protease  36.9 
 
 		 349 aa  44.3  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000140347 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1496  putative periplasmic protease  36.9 
 
 		 349 aa  44.3  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.84 
 
 		 605 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1202  putative periplasmic protease  42.37 
 
 		 324 aa  43.9  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.184937  normal  0.0260504 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  46.3 
 
 		 620 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4371  peptidase S49  39.44 
 
 		 287 aa  43.9  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40840  putative periplasmic protease  31.73 
 
 		 341 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3074  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.52 
 
 		 590 aa  43.5  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250927 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1184  putative periplasmic protease  42.37 
 
 		 326 aa  43.5  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.084263  normal  0.0267663 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0102  putative periplasmic protease  36.9 
 
 		 335 aa  43.5  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2016  putative periplasmic protease  36.62 
 
 		 365 aa  43.5  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000438973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04043  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.05 
 
 		 629 aa  43.5  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0461  putative periplasmic protease  30.86 
 
 		 338 aa  43.1  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1726  putative periplasmic protease  30.86 
 
 		 338 aa  43.1  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3590  peptidase S14 ClpP  33.33 
 
 		 247 aa  42.7  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.226439  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1378  Clp protease  32.14 
 
 		 247 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00455608 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_5654  predicted protein  48 
 
 		 234 aa  43.1  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.221345  normal  0.32323 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2198  putative periplasmic protease  40.32 
 
 		 347 aa  42.7  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000353353 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0560  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.14 
 
 		 596 aa  42.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.789825 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2605  peptidase S14, ClpP  30.12 
 
 		 258 aa  42.4  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3105  peptidase S49  38.96 
 
 		 286 aa  42.4  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.246798 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  32.89 
 
 		 608 aa  42.4  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3463  putative periplasmic protease  30.77 
 
 		 341 aa  42.4  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>