134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_11070 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_11070  periplasmic serine protease (ClpP class)  100 
 
 		 265 aa  533  1e-151  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000898783  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0215  protein of unknown function DUF114  60.62 
 
 		 278 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0321874  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03440  periplasmic serine protease (ClpP class)  61.89 
 
 		 268 aa  333  2e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1661  hypothetical protein  58.33 
 
 		 274 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1020  hypothetical protein  58.33 
 
 		 274 aa  319  3e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1781  hypothetical protein  61.85 
 
 		 276 aa  317  1e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1139  hypothetical protein  61.13 
 
 		 272 aa  315  3e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0926  hypothetical protein  57.58 
 
 		 274 aa  315  6e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0335  hypothetical protein  56.44 
 
 		 281 aa  314  9e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0491521  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1198  hypothetical protein  61.79 
 
 		 283 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1334  protein of unknown function DUF114  56.06 
 
 		 280 aa  311  7.999999999999999e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.611057  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0011  hypothetical protein  58.3 
 
 		 284 aa  311  1e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0011  hypothetical protein  58.3 
 
 		 284 aa  310  2e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3527  protein of unknown function DUF114  54.55 
 
 		 275 aa  305  5.0000000000000004e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0404  protein of unknown function DUF114  56.76 
 
 		 280 aa  305  5.0000000000000004e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3097  hypothetical protein  56.82 
 
 		 282 aa  305  6e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645048 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2943  hypothetical protein  56.44 
 
 		 279 aa  305  6e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2297  protein of unknown function DUF114  56.76 
 
 		 286 aa  301  6.000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1552  hypothetical protein  55.6 
 
 		 279 aa  301  7.000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238673 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1874  hypothetical protein  53.79 
 
 		 297 aa  299  3e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.923248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1401  protein of unknown function DUF114  55.25 
 
 		 277 aa  297  9e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.129163  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0202  protein of unknown function DUF114  56.97 
 
 		 283 aa  297  9e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4766  protein of unknown function DUF114  56.38 
 
 		 296 aa  290  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0583634  hitchhiker  0.000468876 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1299  protein of unknown function DUF114  54.83 
 
 		 277 aa  290  2e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.856082  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0678  hypothetical protein  54.44 
 
 		 279 aa  280  1e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0381  hypothetical protein  51.6 
 
 		 276 aa  278  7e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.824542  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0558  protein of unknown function DUF114  51.15 
 
 		 283 aa  275  4e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1233  hypothetical protein  52.36 
 
 		 292 aa  274  1.0000000000000001e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.17311  normal  0.434623 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2712  protein of unknown function DUF114  51.91 
 
 		 269 aa  273  1.0000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3319  hypothetical protein  50 
 
 		 278 aa  272  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1537  hypothetical protein  54.72 
 
 		 301 aa  271  8.000000000000001e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.675779  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7800  hypothetical protein  49.21 
 
 		 276 aa  269  4e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3600  hypothetical protein  40.23 
 
 		 272 aa  201  8e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.354038  normal  0.0141904 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2112  hypothetical protein  29.17 
 
 		 350 aa  87.8  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.492379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3424  protein of unknown function DUF114  39.08 
 
 		 339 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3346  protein of unknown function DUF114  28.69 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106769  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3471  protein of unknown function DUF114  37.11 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4091  hypothetical protein  33.74 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2773  hypothetical protein  40.95 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3172  protein of unknown function DUF114  33.33 
 
 		 328 aa  67  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.601853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0940  hypothetical protein  29.6 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4681  hypothetical protein  34.41 
 
 		 338 aa  55.5  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2771  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.74 
 
 		 584 aa  53.5  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3727  hypothetical protein  26.15 
 
 		 354 aa  53.5  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.175021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2844  serine protease, ClpP class  38.89 
 
 		 407 aa  52  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0626  peptidase S14 ClpP  30.08 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2605  peptidase S14, ClpP  35.94 
 
 		 258 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0963  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.21 
 
 		 547 aa  50.1  0.00004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.33 
 
 		 633 aa  50.1  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3597  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.52 
 
 		 640 aa  49.3  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1190  protein of unknown function DUF107  38.36 
 
 		 447 aa  48.9  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00806251  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002913  protease IV  26.37 
 
 		 616 aa  48.5  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000149898  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1720  peptidase S14, ClpP  34.43 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  35.71 
 
 		 620 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2235  protease IV  33.33 
 
 		 633 aa  48.5  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0527  peptidase S49  25.95 
 
 		 286 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585752  normal  0.703911 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2845  peptidase S49, SppA  31.43 
 
 		 325 aa  48.1  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.25989  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0130  peptidase S49  30.85 
 
 		 306 aa  47.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.14674  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1941  signal peptide peptidase SppA, 67K type  26.6 
 
 		 613 aa  47.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0528777  normal  0.0163156 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1718  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.53 
 
 		 585 aa  47.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2589  peptidase S49  25.66 
 
 		 292 aa  47  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.901075  normal  0.113657 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3213  peptidase S49  33.77 
 
 		 293 aa  47  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00577792  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2353  putative serine protease SohB  25.21 
 
 		 283 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.169927 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2220  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.35 
 
 		 323 aa  47  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.205102  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2311  acid phosphatase  32.56 
 
 		 612 aa  46.6  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000317657  hitchhiker  0.000195822 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2299  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.56 
 
 		 613 aa  46.6  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000354581  normal  0.336297 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04043  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.72 
 
 		 629 aa  46.6  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4351  peptidase S49  25.58 
 
 		 302 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.244861  hitchhiker  0.00437217 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0908  protease IV family protein  32.91 
 
 		 621 aa  46.2  0.0006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.378235  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2929  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.61 
 
 		 324 aa  46.2  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.359605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1223  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.67 
 
 		 590 aa  46.2  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000375913  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1421  signal peptide peptidase SppA, 36K type  24.32 
 
 		 326 aa  45.8  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000360798  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1193  protein of unknown function DUF107  35 
 
 		 458 aa  45.8  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0874985  normal  0.16265 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2585  signal peptide peptidase SppA, 67K type  27.59 
 
 		 637 aa  45.8  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03044  protease  26.88 
 
 		 616 aa  45.8  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0586  Clp protease  36.07 
 
 		 247 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0403  signal peptide peptidase SppA, 36K type  23.5 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.469925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2253  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.4 
 
 		 613 aa  45.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00027249  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2077  naphthoate synthase  28.26 
 
 		 273 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.310676 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01643  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.07 
 
 		 621 aa  45.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.20854  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0639  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35 
 
 		 321 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0663368 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0193  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35 
 
 		 326 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.116765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1542  naphthoate synthase  32.91 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.04426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0947  proteinase sohB  29.13 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.328239  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  26.19 
 
 		 608 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3971  peptidase S14, ClpP  32.84 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.269828 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1061  peptidase S14, ClpP  34.92 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1081  peptidase S14 ClpP  34.92 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.631599  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0461  peptidase S49  26.77 
 
 		 288 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.361729 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1235  peptidase S49  35.62 
 
 		 300 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3074  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.94 
 
 		 590 aa  44.3  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250927 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0783  peptidase S14 ClpP  33.33 
 
 		 669 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.364039 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  23.5 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.89 
 
 		 605 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1901  signal peptide peptidase SppA, 67K type  25.34 
 
 		 613 aa  43.5  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000029404  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0571  peptidase S49  26.77 
 
 		 286 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0756  peptidase S14 ClpP  33.33 
 
 		 671 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4476  hypothetical protein  37.5 
 
 		 70 aa  43.9  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0068  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35 
 
 		 326 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0824847  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0660  Clp protease  28.23 
 
 		 248 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>