54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3600 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3600  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  557  1e-158  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.354038  normal  0.0141904 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1233  hypothetical protein  42.02 
 
 		 292 aa  219  3.9999999999999997e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.17311  normal  0.434623 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1401  protein of unknown function DUF114  40 
 
 		 277 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.129163  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0215  protein of unknown function DUF114  41.67 
 
 		 278 aa  210  2e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0321874  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1020  hypothetical protein  42.64 
 
 		 274 aa  209  3e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1198  hypothetical protein  43.82 
 
 		 283 aa  209  3e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1661  hypothetical protein  42.64 
 
 		 274 aa  209  3e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0011  hypothetical protein  41.09 
 
 		 284 aa  209  5e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0011  hypothetical protein  41.47 
 
 		 284 aa  209  6e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1874  hypothetical protein  41.41 
 
 		 297 aa  206  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.923248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0926  hypothetical protein  41.89 
 
 		 274 aa  206  5e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0404  protein of unknown function DUF114  42.58 
 
 		 280 aa  204  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7800  hypothetical protein  41.7 
 
 		 276 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3527  protein of unknown function DUF114  42.22 
 
 		 275 aa  204  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0202  protein of unknown function DUF114  42.08 
 
 		 283 aa  204  2e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1334  protein of unknown function DUF114  40.07 
 
 		 280 aa  204  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.611057  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0335  hypothetical protein  43.2 
 
 		 281 aa  203  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0491521  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4766  protein of unknown function DUF114  43.59 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0583634  hitchhiker  0.000468876 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11070  periplasmic serine protease (ClpP class)  42.31 
 
 		 265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000898783  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0558  protein of unknown function DUF114  44.14 
 
 		 283 aa  196  3e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2943  hypothetical protein  39.33 
 
 		 279 aa  196  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1552  hypothetical protein  42.86 
 
 		 279 aa  195  8.000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238673 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03440  periplasmic serine protease (ClpP class)  38.91 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1139  hypothetical protein  40.24 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1537  hypothetical protein  41.46 
 
 		 301 aa  193  3e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.675779  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3097  hypothetical protein  38.58 
 
 		 282 aa  192  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645048 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2297  protein of unknown function DUF114  38.58 
 
 		 286 aa  192  5e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1781  hypothetical protein  41.2 
 
 		 276 aa  191  8e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1299  protein of unknown function DUF114  39.48 
 
 		 277 aa  187  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.856082  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0381  hypothetical protein  40.16 
 
 		 276 aa  186  3e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.824542  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0678  hypothetical protein  37.59 
 
 		 279 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2712  protein of unknown function DUF114  37.78 
 
 		 269 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3319  hypothetical protein  37.4 
 
 		 278 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3471  protein of unknown function DUF114  29.65 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2112  hypothetical protein  31.32 
 
 		 350 aa  70.1  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.492379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4091  hypothetical protein  28.14 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3424  protein of unknown function DUF114  35 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3172  protein of unknown function DUF114  24.59 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.601853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3727  hypothetical protein  38.16 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.175021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4681  hypothetical protein  34.48 
 
 		 338 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214959  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2773  hypothetical protein  33.09 
 
 		 323 aa  54.3  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1836  hypothetical protein  24.74 
 
 		 354 aa  52.8  0.000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1629  R2.LlaJI  24.74 
 
 		 349 aa  51.6  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0248162  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2861  protein of unknown function DUF114  26.83 
 
 		 336 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3346  protein of unknown function DUF114  23.33 
 
 		 258 aa  50.4  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106769  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0940  hypothetical protein  33.33 
 
 		 330 aa  49.7  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0947  proteinase sohB  37.5 
 
 		 288 aa  45.8  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.328239  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0586  Clp protease  25.66 
 
 		 247 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  30.26 
 
 		 620 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1874  peptidase S14, ClpP  24.05 
 
 		 361 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0026  peptidase S49  31.53 
 
 		 417 aa  43.9  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0292498  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0878  hypothetical protein  23.46 
 
 		 338 aa  43.5  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000902689  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1720  peptidase S14, ClpP  28.36 
 
 		 247 aa  42.7  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2389  peptidase S14, ClpP  29.47 
 
 		 351 aa  42.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.142476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>