115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3097 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3097  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  560  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645048 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2943  hypothetical protein  96.63 
 
 		 279 aa  514  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3527  protein of unknown function DUF114  82.29 
 
 		 275 aa  460  9.999999999999999e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2297  protein of unknown function DUF114  66.2 
 
 		 286 aa  383  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0404  protein of unknown function DUF114  66.79 
 
 		 280 aa  371  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1552  hypothetical protein  66.67 
 
 		 279 aa  371  1e-102  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238673 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1334  protein of unknown function DUF114  63.67 
 
 		 280 aa  365  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.611057  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7800  hypothetical protein  64.13 
 
 		 276 aa  362  4e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3319  hypothetical protein  62.03 
 
 		 278 aa  351  7e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0011  hypothetical protein  60.15 
 
 		 284 aa  345  5e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1781  hypothetical protein  63.27 
 
 		 276 aa  343  2e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0011  hypothetical protein  60.15 
 
 		 284 aa  343  2e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0215  protein of unknown function DUF114  60.51 
 
 		 278 aa  341  7e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0321874  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1299  protein of unknown function DUF114  63.81 
 
 		 277 aa  338  5e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.856082  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1874  hypothetical protein  64.42 
 
 		 297 aa  337  9.999999999999999e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.923248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2712  protein of unknown function DUF114  59.4 
 
 		 269 aa  331  9e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03440  periplasmic serine protease (ClpP class)  59.85 
 
 		 268 aa  328  5.0000000000000004e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1661  hypothetical protein  55.43 
 
 		 274 aa  325  4.0000000000000003e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1020  hypothetical protein  54.35 
 
 		 274 aa  322  4e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0926  hypothetical protein  53.99 
 
 		 274 aa  318  3.9999999999999996e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0335  hypothetical protein  58.63 
 
 		 281 aa  318  6e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0491521  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1401  protein of unknown function DUF114  60.98 
 
 		 277 aa  317  1e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.129163  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0381  hypothetical protein  59.92 
 
 		 276 aa  317  2e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.824542  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4766  protein of unknown function DUF114  65.73 
 
 		 296 aa  312  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0583634  hitchhiker  0.000468876 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1198  hypothetical protein  53.58 
 
 		 283 aa  312  4.999999999999999e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1139  hypothetical protein  57.02 
 
 		 272 aa  310  2e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0678  hypothetical protein  59.12 
 
 		 279 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1233  hypothetical protein  57.25 
 
 		 292 aa  299  4e-80  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.17311  normal  0.434623 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0558  protein of unknown function DUF114  56.04 
 
 		 283 aa  290  1e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11070  periplasmic serine protease (ClpP class)  57.38 
 
 		 265 aa  288  6e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000898783  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0202  protein of unknown function DUF114  55 
 
 		 283 aa  288  1e-76  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1537  hypothetical protein  54.65 
 
 		 301 aa  271  9e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.675779  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3600  hypothetical protein  39.06 
 
 		 272 aa  191  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.354038  normal  0.0141904 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2112  hypothetical protein  34 
 
 		 350 aa  98.6  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.492379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3471  protein of unknown function DUF114  38.83 
 
 		 296 aa  85.9  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4091  hypothetical protein  31.87 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3172  protein of unknown function DUF114  28.52 
 
 		 328 aa  73.2  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.601853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3346  protein of unknown function DUF114  28.22 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106769  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3424  protein of unknown function DUF114  34.78 
 
 		 339 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4476  hypothetical protein  54.39 
 
 		 70 aa  64.7  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0940  hypothetical protein  28.14 
 
 		 330 aa  59.3  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  30.57 
 
 		 620 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1836  hypothetical protein  25.2 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4681  hypothetical protein  32.17 
 
 		 338 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1629  R2.LlaJI  25.63 
 
 		 349 aa  55.1  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0248162  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0878  hypothetical protein  24.3 
 
 		 338 aa  54.3  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000902689  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1143  ATP-dependent protease  30.37 
 
 		 683 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2773  hypothetical protein  39.74 
 
 		 323 aa  53.5  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0626  peptidase S14 ClpP  32.8 
 
 		 244 aa  53.5  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1071  ATP-dependent protease  30.37 
 
 		 684 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.146018  hitchhiker  0.00123703 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1408  ATP-dependent protease  30.37 
 
 		 684 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104115  hitchhiker  0.000644227 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2861  protein of unknown function DUF114  23.08 
 
 		 336 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0695  ATP-dependent protease  26.32 
 
 		 689 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.265261  hitchhiker  0.00014029 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1874  peptidase S14, ClpP  49.12 
 
 		 361 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2605  peptidase S14, ClpP  35.59 
 
 		 258 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3727  hypothetical protein  33.01 
 
 		 354 aa  50.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.175021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0514  peptidase S49  26.54 
 
 		 290 aa  49.7  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0130  peptidase S49  34.48 
 
 		 306 aa  48.5  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.14674  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1046  ClpP protease  40.54 
 
 		 280 aa  47.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304732  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1326  hypothetical protein  38.03 
 
 		 388 aa  47.4  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3971  peptidase S14, ClpP  38.24 
 
 		 216 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.269828 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1061  peptidase S14, ClpP  35 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1081  peptidase S14 ClpP  35 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.631599  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  38.98 
 
 		 1156 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2501  peptidase S14 ClpP  39.73 
 
 		 280 aa  47.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0232282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1864  Clp protease domain protein  38.98 
 
 		 651 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657309 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3202  Clp protease domain protein  38.98 
 
 		 651 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.790281  hitchhiker  0.00227439 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0947  proteinase sohB  30.28 
 
 		 288 aa  47  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.328239  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1190  protein of unknown function DUF107  38.71 
 
 		 447 aa  46.6  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00806251  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3866  peptidase S14 ClpP  40.54 
 
 		 280 aa  46.6  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220297 
 
 
-
 
NC_004310  BR0396  protease IV, putative  35.14 
 
 		 368 aa  46.6  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.690183  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2844  serine protease, ClpP class  40.98 
 
 		 407 aa  46.2  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1720  peptidase S14, ClpP  39.62 
 
 		 247 aa  46.2  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0405  putative protease IV  35.14 
 
 		 368 aa  46.6  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2857  peptidase S49  34.85 
 
 		 265 aa  45.8  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1916  signal peptide peptidase A  25.35 
 
 		 270 aa  45.8  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7330  peptidase S14 ClpP  40.68 
 
 		 237 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.307077  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2389  peptidase S14, ClpP  38.96 
 
 		 351 aa  45.8  0.0009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.142476  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0361  peptidase S14, ClpP  38.36 
 
 		 280 aa  45.8  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0990  peptidase S14, ClpP  38.36 
 
 		 280 aa  45.8  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3213  peptidase S49  26.79 
 
 		 293 aa  45.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00577792  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3598  peptidase S14 ClpP  36.36 
 
 		 640 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2353  putative serine protease SohB  37.66 
 
 		 283 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.169927 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0756  peptidase S14 ClpP  36.36 
 
 		 671 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0787  peptidase S14 ClpP  36.36 
 
 		 668 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0494258 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0527  peptidase S49  35.21 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585752  normal  0.703911 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0783  peptidase S14 ClpP  36.36 
 
 		 669 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.364039 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0586  Clp protease  35.59 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0571  peptidase S49  36.62 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2771  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.33 
 
 		 584 aa  45.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0643  peptidase S14, ClpP  28.5 
 
 		 282 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13811  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  33.33 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.99906  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0730  protein of unknown function DUF107  33.33 
 
 		 828 aa  44.3  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.553992  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.48 
 
 		 633 aa  44.7  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0900  Clp protease domain protein  26.32 
 
 		 652 aa  44.3  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1281  signal peptide peptidase A  32.1 
 
 		 269 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2589  peptidase S49  36.36 
 
 		 292 aa  43.5  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.901075  normal  0.113657 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2190  peptidase S14, ClpP  32.97 
 
 		 688 aa  43.5  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000592191 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2220  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.94 
 
 		 323 aa  43.5  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.205102  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0385  S49 family peptidase  33.78 
 
 		 283 aa  43.1  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>